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Version du 16 novembre 2018 à 16:33
Ingénieur de Recherche - HDR
Responsable du thème Traitement d'Images BioMédicales
Responsable du pôle Informatique et Traitement d'Images de la plate-forme IRIS
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Description des activités
Mes activités de recherche dans l'équipe IMAGeS concernent le Traitement d'images biomédicales et recouvrent principalement deux thématiques :
- le recalage d'images
- la détection de changements dans des séquences d'images
Par ailleurs, dans le cadre de mes activités au sein de la plate-forme Imagines, j'apporte mon expertise pour l’investigation de différentes problématiques en neurosciences requérant la mise en place de chaînes de traitement d’images adaptées et l’exploitation de bases de données d’images.
Parcours
juin 2015 | : Habilitation à diriger des recherches , UDS, Strasbourg |
Depuis 2005 | : Ingénieur de recherche CNRS, ICube |
2002 - 2006 | : Doctorat (allocataire-moniteur), LSIIT, UMR 7005, ULP, Strasbourg |
2001 - 2002 | : D.E.A. Mécanique et Ingénierie, option Biomécanique, ULP, Strasbourg |
1999 - 2002 | : Ingénieur ENSPS (Ecole Nationale Supérieure de Physique de Strasbourg) |
Encadrements
Thèses en cours :
- "Evaluation précoce de la croissance tumorale des résidus post-chirurgicaux des glioblastomes par IRM-ITD", Thèse de Céline Heimburger (2015-), Co-direction avec Izzie Jacques Namer
- "Biomarqueurs diagnostiques en IRM cérébrale multimodale de la maladie à corps de Lewy et de la maladie d'Alzheimer", Thèse de Elena Chabran (2016-), Co-direction avec Frédéric Blanc
- "Développement d'un modèle informatique pour optimiser l'appariement donneur/receveur en transplantation hépatique", Thèse de Pietro Addeo (2017-), Co-encadrement avec Benoit Naegel (directeur de thèse), Philippe Bachellier (co-directeur), et Adrien Krähenbühl (encadrant).
- "Nouvelles approches radiomiques pour la caractérisation de tumeurs hépatiques par analyse d’images", Thèse de Farid Ouhmich (2017-), Co-direction avec Fabrice Heitz, encadrement Vincent Agnus.
- "Nouvelles approches radiomiques pour la caractérisation de tumeurs hépatiques par analyse d’images", Thèse de Farid Ouhmich (2017-), Co-direction avec Fabrice Heitz, encadrement Vincent Agnus.
- "Cadre unifié pour la détection de changements en IRM cérébrale multimodale. Application au suivi longitudinal de patients atteints de sclérose en plaques.", Thèse de Eléonore Dufresne, (2018-), Co-direction avec Stéphane Kremer, encadrement Denis Fortun
Thèses soutenues :
- "Modèles de régression multivariés pour la comparaison de populations en IRM de diffusion", Thèse d'Alix Bouchon (2012-2016), Co-encadrement avec Fabrice Heitz
- "Imagerie quantitative de la ventilation par tomodensitométrie double-énergie", Thèse d'Mickael Ohana (2013-2016), Co-encadrement avec Fabrice Heitz et Catherine Roy
- "Approches statistiques pour la détection de changements en IRM de diffusion. Application au suivi longitudinal de pathologies neuro-dégénératives", Thèse d'Antoine Grigis (2009-2012), Co-encadrement avec Fabrice Heitz et Jean-Paul Armspach.
- "Détection automatique de changements en IRM de diffusion : Application à la sclérose en plaques", Thèse de Hervé Boisgontier (2006-2010), Co-encadrement avec Fabrice Heitz et Jean-Paul Armspach.
Enseignements
- Cours "Dispositifs d'imagerie médicale" dans le Master Images, Robotique et Ingénierie du Vivant (Université de Strasbourg)
- Cours "Introduction aux traitement d'images médicales" à l'école Telecom Physique Strasbourg, diplôme TI santé
- Cours "Traitement d'images médicales" dans le Master Images, Robotique et Ingénierie du Vivant (Université de Strasbourg)
- Cours "Traitement d'images médicales avancé" à l'école Telecom Physique Strasbourg, diplôme TI santé
- Cours " Traitement d'images TI Santé 2A" à l'école Telecom Physique Strasbourg, diplôme TI santé