Équipe IMAGeS : Images, Modélisation, Apprentissage, Géométrie et Statistique

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De Équipe IMAGeS : Images, Modélisation, Apprentissage, Géométrie et Statistique
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| ICube - MIV<br /> 300 Bd Sébastien Brant<br /> BP 10413<br />  67412 Illkirch CEDEX - France <br /><br /> Tel : + 33 (0) 3 68 85 44 89<br />      Fax : + 33 (0) 3 68 85 44 97<br />      Bureau : '''C211''' <br />
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| ICube - IMAGeS<br /> 300 Bd Sébastien Brant<br /> BP 10413<br />  67412 Illkirch CEDEX - France <br />
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'''Site d'Illkirch''' <br />Tel : + 33 (0) 3 68 85 43 58<br />      Bureau : C211 <br />
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Courriel : '''vincent(dot)noblet(at)unistra(dot)fr'''<br />
 
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== Description des activités ==
 
== Description des activités ==
  
Mes activités de recherche sont dans le domaine du traitement des images médicales et recouvrent principalement deux thématiques :
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Mes activités de recherche dans l'équipe IMAGeS concernent le [[Traitement d'images biomédicales]] et recouvrent principalement deux thématiques :
 
* le recalage d'images
 
* le recalage d'images
 
* la détection de changements dans des séquences d'images
 
* la détection de changements dans des séquences d'images
  
Thèses encadrées :
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Par ailleurs, dans le cadre de mes activités au sein de la [http://plateforme.icube.unistra.fr/gaia/index.php/Accueil plate-forme GAIA] et de la [http://plateforme.icube.unistra.fr/iris/index.php/Accueil plate-forme IRIS], j'apporte mon expertise en analyse de données et traitement d'images pour différentes problématiques applicatives en lien avec des partenaires académiques ou industriels.
* "Détection statistique de changements longitudinaux en imagerie IRM anatomique et de diffusion. Application aux pathologies dégénératives du système nerveux central", Thèse d'[[Alix Bouchon]] (2012- ), Co-encadrement avec [[Fabrice Heitz]]
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== Parcours ==
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| juin 2015 || :  [http://icube-publis.unistra.fr/docs/9456/HDR-Noblet.pdf Habilitation à diriger des recherches] , UDS, Strasbourg
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| Depuis 2005 ||  :  Ingénieur de recherche CNRS, ICube
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| 2002 - 2006  || :  [http://icube-publis.unistra.fr/docs/1469/these_noblet.pdf Doctorat] (allocataire-moniteur), LSIIT, UMR 7005, ULP, Strasbourg
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| 2001 - 2002 || :  D.E.A. Mécanique et Ingénierie, option Biomécanique, ULP, Strasbourg 
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| 1999 - 2002 || :  Ingénieur ENSPS (Ecole Nationale Supérieure de Physique de Strasbourg)
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== Encadrements ==
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Thèses en cours :
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* "Analyse d’IRM cérébrales de souris par apprentissage profond. Application à la caractérisation de modèles murins pour l’étude de la comorbidité douleur chronique et les troubles anxiodépressifs.", Thèse de Franck Valentini.(2021-), Co-direction avec Laura Harsan, encadrement [[Alex Lallement]].
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* "Méthodes d'intelligence artificielle pour l'amélioration de la mesure d'un réseau de capteurs sur une installation électrique industrielle" , Thèse de  Hamza Nait Hmid.(2022-), Co-encadrement avec Vincent Mazet (directeur de thèse). Thèse CIFRE avec [https://www.socomec.fr/ Socomec].
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Thèses soutenues :
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* "Segmentation sémantique d'images TDM 3D du poumon par apprentissage profond.", Thèse d'Adrien Heitz (2020-2023), Co-direction avec [[Fabrice Heitz]] (directeur de thèse). Thèse CIFRE avec [https://www.visiblepatient.com/ Visible Patient].
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* "Cadre unifié pour la détection de changements en IRM cérébrale multimodale. Application au suivi longitudinal de patients atteints de sclérose en plaques.", Thèse de [[Eleonore Dufresne]], (2018-2023), Co-direction avec Stéphane Kremer, encadrement [[Denis Fortun]].
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* "Nouvelles approches radiomiques pour la caractérisation de tumeurs hépatiques par analyse d’images", Thèse de Farid Ouhmich (2017-2021), Co-direction avec [[Fabrice Heitz]], encadrement Vincent Agnus.
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* "Développement d'un modèle informatique pour optimiser l'appariement donneur/receveur en transplantation hépatique", Thèse de Pietro Addeo (2017-2021), Co-encadrement avec [[Benoit Naegel]] (directeur de thèse), Philippe Bachellier (co-directeur).
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* "Biomarqueurs diagnostiques en IRM cérébrale multimodale de la maladie à corps de Lewy et de la maladie d'Alzheimer", Thèse de Elena Chabran (2016-2019), Co-direction avec Frédéric Blanc
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* "Modèles de régression multivariés pour la comparaison de populations en IRM de diffusion", Thèse d'[[Alix Bouchon]] (2012-2016), Co-encadrement avec [[Fabrice Heitz]]
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* "Imagerie quantitative de la ventilation par tomodensitométrie double-énergie", Thèse d'[[Mickael Ohana]] (2013-2016), Co-encadrement avec [[Fabrice Heitz]] et Catherine Roy
  
* "Détection de changements en IRM de diffusion. Application à la détection précoce de l'évolution des tumeurs cérébrales et des lésions de sclérose en plaques", Thèse d'[http://antoine.grigis.voila.net Antoine Grigis] (2009-2012), Co-encadrement avec [[Fabrice Heitz]], [http://www-ipb.u-strasbg.fr/staff/armspach/ Jean-Paul Armspach].
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* "[http://antoine.grigis.voila.net/files/publication/phd12.pdf.zip Approches statistiques pour la détection de changements en IRM de diffusion. Application au suivi longitudinal de pathologies neuro-dégénératives]", Thèse d'[http://antoine.grigis.voila.net Antoine Grigis] (2009-2012), Co-encadrement avec [[Fabrice Heitz]] et [http://www-ipb.u-strasbg.fr/staff/armspach/ Jean-Paul Armspach].
  
* "Reconstruction et suivi de fibres en imagerie par résonance magnétique du tenseur de diffusion. Application à l’étude longitudinale en sclérose en plaques", Thèse de [http://herve.boisgontier.free.fr Hervé Boisgontier] (2006-2010), Co-encadrement avec [[Fabrice Heitz]], [http://www-ipb.u-strasbg.fr/staff/armspach/ Jean-Paul Armspach].
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* "[http://herve.boisgontier.free.fr/cv/ressources/theseHerveBoisgontier.pdf Détection automatique de changements en IRM de diffusion : Application à la sclérose en plaques]", Thèse de [http://herve.boisgontier.free.fr Hervé Boisgontier] (2006-2010), Co-encadrement avec [[Fabrice Heitz]] et [http://www-ipb.u-strasbg.fr/staff/armspach/ Jean-Paul Armspach].
  
Enseignements :
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* TD Traitement du signal (1A/2A) à l'école [http://www.telecom-physique.fr Telecom Physique Strasbourg]
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== Enseignements ==
* Cours "[[Dispositifs d'imagerie médicale]]" dans le [http://master-iriv.u-strasbg.fr Master Images, Sciences et Technologies de l'Information] (Université de Strasbourg)
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* Lecture "[[HealthTech_Introduction_to_Medical_Image_Processing |Introduction to medical image processing]]" M2 HealthTech and option 3A ISSD of [http://www.telecom-physique.fr Telecom Physique]
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* Lecture "[[HealthTech_Advanced_Medical_Image_Processing:_Modalities_and_Medical_Insight |Advanced medical image processing: modalities and medical insight]]" M2 HealthTech and [http://master-iriv.u-strasbg.fr Master Images, Robotique et Ingénierie du Vivant] (Université de Strasbourg)
 +
* Lecture "[[HealthTech_Advanced_Medical_Image_Processing:_methods |Advanced medical image processing: methods]]" M2 HealthTech and [http://master-iriv.u-strasbg.fr Master Images, Robotique et Ingénierie du Vivant] (Université de Strasbourg)
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* Cours "[[cours_TIM_3A_ISSD |Introduction au Traitement d'images médicales]]" en 2A, département STS, à l'école [http://www.telecom-physique.fr Telecom Physique Strasbourg]
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<!-- * Cours "[[Cours_TIM_avancé | Traitement d'images médicales avancé]]" à l'école [http://www.telecom-physique.fr Telecom Physique Strasbourg], diplôme [http://ticsante.u-strasbg.fr TI santé] et [http://master-iriv.u-strasbg.fr Master Images, Robotique et Ingénierie du Vivant] (Université de Strasbourg) -->
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<!--  * Cours "[[Dispositifs d'imagerie médicale]]" dans le [http://master-iriv.u-strasbg.fr Master Images, Robotique et Ingénierie du Vivant] (Université de Strasbourg) -->
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<!-- * Cours "[[Introduction aux traitement d'images médicales]]" à l'école [http://www.telecom-physique.fr Telecom Physique Strasbourg], diplôme [http://ticsante.u-strasbg.fr TI santé] -->
 +
<!-- * Cours "[[cours_TIM |Traitement d'images médicales]]" dans le [http://master-iriv.u-strasbg.fr Master Images, Robotique et Ingénierie du Vivant] (Université de Strasbourg) -->
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<!-- * Cours "[[Traitement_d'images_TICS2A | Traitement d'images TI Santé 2A]]" à l'école [http://www.telecom-physique.fr Telecom Physique Strasbourg], diplôme [http://ticsante.u-strasbg.fr TI santé] -->
  
 
== Publications ==
 
== Publications ==
  
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=== Journaux ===
http://newlsiit.u-strasbg.fr/papr/appli.php?author=noblet&title=&labo=4&team=toutes&annee1=&annee2=&display=rap+&nationalRank=toutes&project=tous&hide=0&hide=0
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=== Conférences ===
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Version actuelle datée du 12 avril 2024 à 06:57

Ingénieur de Recherche - HDR
       Responsable technique de la plateforme GAIA
       Responsable du pôle Informatique et Traitement d'Images de la plate-forme IRIS

ICube - IMAGeS
300 Bd Sébastien Brant
BP 10413
67412 Illkirch CEDEX - France

Site d'Illkirch
Tel : + 33 (0) 3 68 85 43 58
Bureau : C211

Courriel : vincent(dot)noblet(at)unistra(dot)fr

VincentNoblet.jpg

Description des activités

Mes activités de recherche dans l'équipe IMAGeS concernent le Traitement d'images biomédicales et recouvrent principalement deux thématiques :

  • le recalage d'images
  • la détection de changements dans des séquences d'images

Par ailleurs, dans le cadre de mes activités au sein de la plate-forme GAIA et de la plate-forme IRIS, j'apporte mon expertise en analyse de données et traitement d'images pour différentes problématiques applicatives en lien avec des partenaires académiques ou industriels.

Parcours

juin 2015 : Habilitation à diriger des recherches , UDS, Strasbourg
Depuis 2005 : Ingénieur de recherche CNRS, ICube
2002 - 2006 : Doctorat (allocataire-moniteur), LSIIT, UMR 7005, ULP, Strasbourg
2001 - 2002 : D.E.A. Mécanique et Ingénierie, option Biomécanique, ULP, Strasbourg
1999 - 2002 : Ingénieur ENSPS (Ecole Nationale Supérieure de Physique de Strasbourg)


Encadrements

Thèses en cours :

  • "Analyse d’IRM cérébrales de souris par apprentissage profond. Application à la caractérisation de modèles murins pour l’étude de la comorbidité douleur chronique et les troubles anxiodépressifs.", Thèse de Franck Valentini.(2021-), Co-direction avec Laura Harsan, encadrement Alex Lallement.
  • "Méthodes d'intelligence artificielle pour l'amélioration de la mesure d'un réseau de capteurs sur une installation électrique industrielle" , Thèse de Hamza Nait Hmid.(2022-), Co-encadrement avec Vincent Mazet (directeur de thèse). Thèse CIFRE avec Socomec.

Thèses soutenues :

  • "Segmentation sémantique d'images TDM 3D du poumon par apprentissage profond.", Thèse d'Adrien Heitz (2020-2023), Co-direction avec Fabrice Heitz (directeur de thèse). Thèse CIFRE avec Visible Patient.
  • "Cadre unifié pour la détection de changements en IRM cérébrale multimodale. Application au suivi longitudinal de patients atteints de sclérose en plaques.", Thèse de Eleonore Dufresne, (2018-2023), Co-direction avec Stéphane Kremer, encadrement Denis Fortun.
  • "Nouvelles approches radiomiques pour la caractérisation de tumeurs hépatiques par analyse d’images", Thèse de Farid Ouhmich (2017-2021), Co-direction avec Fabrice Heitz, encadrement Vincent Agnus.
  • "Développement d'un modèle informatique pour optimiser l'appariement donneur/receveur en transplantation hépatique", Thèse de Pietro Addeo (2017-2021), Co-encadrement avec Benoit Naegel (directeur de thèse), Philippe Bachellier (co-directeur).
  • "Biomarqueurs diagnostiques en IRM cérébrale multimodale de la maladie à corps de Lewy et de la maladie d'Alzheimer", Thèse de Elena Chabran (2016-2019), Co-direction avec Frédéric Blanc
  • "Modèles de régression multivariés pour la comparaison de populations en IRM de diffusion", Thèse d'Alix Bouchon (2012-2016), Co-encadrement avec Fabrice Heitz
  • "Imagerie quantitative de la ventilation par tomodensitométrie double-énergie", Thèse d'Mickael Ohana (2013-2016), Co-encadrement avec Fabrice Heitz et Catherine Roy


Enseignements


Publications

Journaux

Conférences