Différences entre les versions de « Fabrice Heitz »
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=== Responsabilités collectives === | === Responsabilités collectives === | ||
− | * Responsable de l'équipe IMAGeS ICube (2016-) | + | * Directeur du Laboratoire [http://icube.unistra.fr/icube/index.php/Accueil ICube] (2023-) |
− | * Directeur-adjoint du Laboratoire [http://icube.unistra.fr/icube/index.php/Accueil ICube], directeur du département IRTS (2013-) | + | * Responsable de l'équipe IMAGeS d'ICube (2016-2022) |
+ | * Directeur-adjoint du Laboratoire [http://icube.unistra.fr/icube/index.php/Accueil ICube], directeur du département IRTS (2013-2022) | ||
* Directeur du LSIIT UMR 7005 CNRS / Université de Strasbourg (2005-2012) | * Directeur du LSIIT UMR 7005 CNRS / Université de Strasbourg (2005-2012) | ||
* Membre élu de la Commission de la Recherche de l'Université de Strasbourg (2021-2025) | * Membre élu de la Commission de la Recherche de l'Université de Strasbourg (2021-2025) | ||
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* Expert AERES / HCERES (président et membre de comité de visite), ANR, auprès du MESR (DSPT), Oseo-Anvar, ANRT, Région Alsace. | * Expert AERES / HCERES (président et membre de comité de visite), ANR, auprès du MESR (DSPT), Oseo-Anvar, ANRT, Région Alsace. | ||
* Membre nommé du CNU 61ème section (2004-2007) | * Membre nommé du CNU 61ème section (2004-2007) | ||
− | * Membre élu du conseil scientifique de l' | + | * Chargé de mission STIC auprès du VP recherche de l'Université Strasbourg 1(2003-2007) |
+ | * Membre élu du conseil scientifique de l'Université Strasbourg 1 (1999-2006) | ||
* Membre du comité de pilotage du GDR ISIS (2001-2004) | * Membre du comité de pilotage du GDR ISIS (2001-2004) | ||
* Responsable du DEA "Photonique, Image, Cybernétique" ULP (1999-2005) | * Responsable du DEA "Photonique, Image, Cybernétique" ULP (1999-2005) | ||
* Responsable du Pôle Image Région Alsace (CPER 1999-2004) | * Responsable du Pôle Image Région Alsace (CPER 1999-2004) | ||
* Editeur associé de la revue IEEE Transactions on Image Processing (1996-1999) | * Editeur associé de la revue IEEE Transactions on Image Processing (1996-1999) | ||
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=== Curriculum Vitae === | === Curriculum Vitae === | ||
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* [http://www-l2ti.univ-paris13.fr/~bosc/ Marcel Bosc] : « Détection de changements dans des séquences d’images médicales 3D multimodales. Application à la détection et au suivi des lésions de scléroses en plaques » (décembre 2003). Maître de Conférences, Université Paris 13, Laboratoire de Traitement et de Transport de l’Information (L2TI). [http://scd-theses.u-strasbg.fr/1167/01/dahyot2001.pdf Thèse] | * [http://www-l2ti.univ-paris13.fr/~bosc/ Marcel Bosc] : « Détection de changements dans des séquences d’images médicales 3D multimodales. Application à la détection et au suivi des lésions de scléroses en plaques » (décembre 2003). Maître de Conférences, Université Paris 13, Laboratoire de Traitement et de Transport de l’Information (L2TI). [http://scd-theses.u-strasbg.fr/1167/01/dahyot2001.pdf Thèse] | ||
− | * [https://www. | + | * [https://www.linkedin.com/in/torbjörn-vik-b424593b/ Torbjorn Vik] : « Modèles statistiques d’apparence 3D. Application à la création d’un atlas probabiliste de perfusion cérébrale pour l’aide au diagnostic » (décembre 2004). Senior Scientist, Philips, Eindhoven, Netherlands. [http://scd-theses.u-strasbg.fr/881/01/VIK2004.pdf Thèse] |
* [https://images.icube.unistra.fr/index.php/Sylvain_Faisan Sylvain Faisan] : « Analyse et fusion markovienne de séquences en imagerie 3D+t. Application à l’analyse de séquences d’images IRM fonctionnelles cérébrales » (décembre 2004, prix de thèse de l'Université de Strasbourg). Maître de Conférences HDR à Télécom Physique Strasbourg. [http://scd-theses.u-strasbg.fr/886/01/Faisan2004.pdf Thèse] | * [https://images.icube.unistra.fr/index.php/Sylvain_Faisan Sylvain Faisan] : « Analyse et fusion markovienne de séquences en imagerie 3D+t. Application à l’analyse de séquences d’images IRM fonctionnelles cérébrales » (décembre 2004, prix de thèse de l'Université de Strasbourg). Maître de Conférences HDR à Télécom Physique Strasbourg. [http://scd-theses.u-strasbg.fr/886/01/Faisan2004.pdf Thèse] | ||
− | * [https:// | + | * [https://scholar.google.com/citations?user=BaBgV7kAAAAJ&hl=fr&oi=sra Alban Foulonneau] : « Une contribution à l’introduction de contraintes de forme dans les contours actifs orientés région » (décembre 2004). Maître de Conférences à l’Université de Haute Alsace, laboratoire MIPS Modélisation, Intelligence, Processus, Systèmes. [https://www.theses.fr/2004STR13140 Thèse] |
* [https://images.icube.unistra.fr/index.php/Vincent_Noblet Vincent Noblet] : « Recalage non rigide d’images cérébrales 3D avec contrainte de conservation de la topologie » (mars 2006). Ingénieur de Recherche CNRS HDR à ICube, Strasbourg. [http://scd-theses.u-strasbg.fr/1127/01/THESE_NOBLET.PDF Thèse] | * [https://images.icube.unistra.fr/index.php/Vincent_Noblet Vincent Noblet] : « Recalage non rigide d’images cérébrales 3D avec contrainte de conservation de la topologie » (mars 2006). Ingénieur de Recherche CNRS HDR à ICube, Strasbourg. [http://scd-theses.u-strasbg.fr/1127/01/THESE_NOBLET.PDF Thèse] | ||
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* [https://agrigis.github.io/biopic/ Antoine Grigis] : « Approches statistiques pour la détection de changements en IRM de diffusion. Application au suivi longitudinal de pathologies neuro-dégénératives » (septembre 2012, prix de thèse de l'Université de Strasbourg). Ingénieur-chercheur (CDI) au CEA (centre Neurospin). [http://www.theses.fr/2012STRAD018 Thèse] | * [https://agrigis.github.io/biopic/ Antoine Grigis] : « Approches statistiques pour la détection de changements en IRM de diffusion. Application au suivi longitudinal de pathologies neuro-dégénératives » (septembre 2012, prix de thèse de l'Université de Strasbourg). Ingénieur-chercheur (CDI) au CEA (centre Neurospin). [http://www.theses.fr/2012STRAD018 Thèse] | ||
− | * [https://fr.linkedin.com/in/gil-gaullier-b3a48b20b Gil Gaullier] : « Modèles déformables contraints en reconstruction d'images de tomographie non linéaire par temps d'arrivée » (septembre 2013). Ingénieur | + | * [https://fr.linkedin.com/in/gil-gaullier-b3a48b20b Gil Gaullier] : « Modèles déformables contraints en reconstruction d'images de tomographie non linéaire par temps d'arrivée » (septembre 2013). Ingénieur de recherche CEA-Leti [http://www.theses.fr/2013STRAD026 Thèse] |
* [https://www.linkedin.com/in/micka%C3%ABl-ohana-bb696261 Mickael Ohana] : « Imagerie de la ventilation par tomodensitométrie double énergie simple source avec inhalation de gaz noble » (juin 2016). PU-PH Radiologie - Imagerie cardio-vasculaire et thoracique, Hôpitaux Universitaires de Strasbourg. [http://www.theses.fr/s103428 Thèse] | * [https://www.linkedin.com/in/micka%C3%ABl-ohana-bb696261 Mickael Ohana] : « Imagerie de la ventilation par tomodensitométrie double énergie simple source avec inhalation de gaz noble » (juin 2016). PU-PH Radiologie - Imagerie cardio-vasculaire et thoracique, Hôpitaux Universitaires de Strasbourg. [http://www.theses.fr/s103428 Thèse] | ||
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* [https://www.linkedin.com/in/alix-bouchon-333482169 Alix Bouchon] : « Modèles de régression multivariés pour la comparaison de populations en IRM de diffusion » (septembre 2016). Ingénieur Sogeti, Strasbourg. [http://www.theses.fr/s78206 Thèse] | * [https://www.linkedin.com/in/alix-bouchon-333482169 Alix Bouchon] : « Modèles de régression multivariés pour la comparaison de populations en IRM de diffusion » (septembre 2016). Ingénieur Sogeti, Strasbourg. [http://www.theses.fr/s78206 Thèse] | ||
− | * [https://www.linkedin.com/in/florian-tilquin-110387150 | + | * [https://www.linkedin.com/in/florian-tilquin-phd-110387150 Florian Tilquin] : « Statistical Models on Manifolds for Anomaly Detection on Medical Images » (novembre 2019). Machine Learning Engineer, Biosency (CDI), Rennes. [https://www.theses.fr/243231105 Thèse] |
* [https://fr.linkedin.com/in/farid-ouhmich-069272106 Farid Ouhmich]: "New radiomics approaches for hepatic tumor characterization through imaging analysis" (juin 2021). Data scientist chez Orthogrid, Strasbourg. [http://www.theses.fr/s269230 Thèse] | * [https://fr.linkedin.com/in/farid-ouhmich-069272106 Farid Ouhmich]: "New radiomics approaches for hepatic tumor characterization through imaging analysis" (juin 2021). Data scientist chez Orthogrid, Strasbourg. [http://www.theses.fr/s269230 Thèse] | ||
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* [https://images.icube.unistra.fr/index.php/Argheesh_Bhanot Argheesh Bhanot]: « Apprentissage par dictionnaire pour la séparation de sources sous contraintes spatiales » (juillet 2021). Post-doctorat GIPSA-lab, Grenoble. [http://www.theses.fr/s269784 Thèse] | * [https://images.icube.unistra.fr/index.php/Argheesh_Bhanot Argheesh Bhanot]: « Apprentissage par dictionnaire pour la séparation de sources sous contraintes spatiales » (juillet 2021). Post-doctorat GIPSA-lab, Grenoble. [http://www.theses.fr/s269784 Thèse] | ||
− | * [https:// | + | * [https://www.linkedin.com/in/dr-romel-bhattacharjee-a5695254/ Romel Bhattacharjee]: "Deformable Registration of Abdominal Images". PhD Indian Institute of Technology IIT, Banaras Hindu University, Varanasi (sept. 2021). Analyst (Engineer in Technology Research & Advisory), Aranca, Mumbai, Maharashtra, India [https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1959031820300816 Pub] |
Version actuelle datée du 27 mars 2023 à 10:26
Professeur, Directeur du Laboratoire ICube
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Thématiques de recherche
- Traitement du signal et des images.
- Modélisation statistique (images 3D+t), modèles markoviens et modèles non gaussiens, modèles d'apparence, modèles déformables.
- Apprentissage (Machine Learning).
- Recalage rigide et déformable d'images multimodales, segmentation d'images 3D, suivi temporel 3D+t, détection de changements inter-images.
- Applications : imagerie médicale, analyse de séquences temporelles.
Enseignement
- Cours / TP / TD :
Encadrement de thèses
- Kaifeng Zou. Age and Sex Estimation from CT Images using Keypoints and Machine Learning Methods. Co-direction avec S. Faisan et S. Valette (Creatis). Projet ANR Topacs. (depuis sept. 2020).
- Adrien Heitz. Segmentation sémantique d'images TDM 3D du poumon par apprentissage profond. Co-direction de thèse avec V. Noblet (depuis juin 2020). Thèse CIFRE avec Visible Patient.
- Guillaume Décor. Reconnaissance des formes pour l’inspection des tunnels. Co-direction de thèse avec P. Charbonnier (DR CEREMA, encadrement P. Foucher (depuis octobre 2018). Thèse financée par le Cerema.
Responsabilités collectives
- Directeur du Laboratoire ICube (2023-)
- Responsable de l'équipe IMAGeS d'ICube (2016-2022)
- Directeur-adjoint du Laboratoire ICube, directeur du département IRTS (2013-2022)
- Directeur du LSIIT UMR 7005 CNRS / Université de Strasbourg (2005-2012)
- Membre élu de la Commission de la Recherche de l'Université de Strasbourg (2021-2025)
- Membre nommé du Conseil scientifique de l'Université de Lorraine (2017-2021)
- Membre élu du Conseil scientifique de l'Université de Strasbourg (2009-2012)
- Membre élu du conseil de Télécom Physique Strasbourg
- Expert AERES / HCERES (président et membre de comité de visite), ANR, auprès du MESR (DSPT), Oseo-Anvar, ANRT, Région Alsace.
- Membre nommé du CNU 61ème section (2004-2007)
- Chargé de mission STIC auprès du VP recherche de l'Université Strasbourg 1(2003-2007)
- Membre élu du conseil scientifique de l'Université Strasbourg 1 (1999-2006)
- Membre du comité de pilotage du GDR ISIS (2001-2004)
- Responsable du DEA "Photonique, Image, Cybernétique" ULP (1999-2005)
- Responsable du Pôle Image Région Alsace (CPER 1999-2004)
- Editeur associé de la revue IEEE Transactions on Image Processing (1996-1999)
Curriculum Vitae
Publications
Anciens doctorants
- Etienne Mémin : « Algorithmes et architectures parallèles pour les approches markoviennes en analyse d’images » (juin 1993). Directeur de Recherches INRIA (Centre INRIA Rennes), responsable de l’équipe-projet INRIA « Fluminance ».
- Patrick Perez : « Champs markoviens et analyse multirésolution de l’image : application à l’analyse du mouvement » (juillet 1993). Directeur de Recherches INRIA (centre INRIA Rennes). Directeur de valeo.ai (Valeo AI research lab).
- Charles Kervrann : « Modèles statistiques pour la segmentation et le suivi de structures déformables bidimensionnelles dans une séquence d’images » (novembre 1995). Directeur de Recherches INRIA (Centre INRIA Rennes), responsable de l’équipe-projet « Serpico ».
- Jean-Marc Laferté : « Contribution à l’analyse d’images par modèles markoviens sur des graphes hiérarchiques. Application à la fusion de données multirésolutions » (octobre 1996). Enseignant–chercheur Département Génie logiciel et Techniques de l’Information à l'ECAM-Rennes.
- Christophoros Nikou : « Contribution au recalage d’images médicales multimodales : approches par fonctions de similarité robustes et modèles déformables physiques sous contraintes statistiques » (mai 1999). Professor, Computer Science Department, University of Ioannina, Grèce.
- Olivier Musse : « Contribution à la mise en correspondance non rigide d’images médicales : une approche paramétrique hiérarchique sous contraintes topologiques. Application au recalage déformable du cerveau en imagerie IRM » (décembre 2000). CEO, Mana-Sys, Rennes.
- Raouf Hamdan : « Détection, suivi et reconnaissance des formes et du mouvement par modèles probabilistes d’apparence »(janvier 2001). Associate Professor, Arab International University, Syria.
- Rozenn Dahyot : « Reconnaissance des formes et indexation par le contenu de bases de données d’images séquentielles pour la gestion du réseau routier » (novembre 2001). Professor of Computer Science, Maynooth University, Ireland. Thèse
- Michel Salomon : « Parallélisation d’algorithmes d’optimisation globale pour le recalage d’images par fonctions de similarité »(décembre 2001). Maître de Conférences, Université de Franche-Comté, Laboratoire d’Informatique de Franche-Comté. Thèse
- Marcel Bosc : « Détection de changements dans des séquences d’images médicales 3D multimodales. Application à la détection et au suivi des lésions de scléroses en plaques » (décembre 2003). Maître de Conférences, Université Paris 13, Laboratoire de Traitement et de Transport de l’Information (L2TI). Thèse
- Torbjorn Vik : « Modèles statistiques d’apparence 3D. Application à la création d’un atlas probabiliste de perfusion cérébrale pour l’aide au diagnostic » (décembre 2004). Senior Scientist, Philips, Eindhoven, Netherlands. Thèse
- Sylvain Faisan : « Analyse et fusion markovienne de séquences en imagerie 3D+t. Application à l’analyse de séquences d’images IRM fonctionnelles cérébrales » (décembre 2004, prix de thèse de l'Université de Strasbourg). Maître de Conférences HDR à Télécom Physique Strasbourg. Thèse
- Alban Foulonneau : « Une contribution à l’introduction de contraintes de forme dans les contours actifs orientés région » (décembre 2004). Maître de Conférences à l’Université de Haute Alsace, laboratoire MIPS Modélisation, Intelligence, Processus, Systèmes. Thèse
- Vincent Noblet : « Recalage non rigide d’images cérébrales 3D avec contrainte de conservation de la topologie » (mars 2006). Ingénieur de Recherche CNRS HDR à ICube, Strasbourg. Thèse
- Matthieu Brucher : « Représentations compactes et apprentissage non supervisé de variétés non linéaires. Application au traitement d’images » (octobre 2008). Quantitative Researcher at Squarepoint Capital, Londres, Royaume-Uni. Thèse
- Hervé Boisgontier : « Détection automatique de changements en IRM de diffusion. Application à l’étude longitudinale de patients atteints de sclérose en plaques » (juillet 2010). Formateur développement informatique, ENI Nantes. Thèse
- Swati Sharma : « Recalage déformable d'images médicales 3D multi-modales. Application à la mesure de l’atrophie cérébrale dans la sclérose en plaques » (septembre 2011). Senior Researcher at Microsoft Azure, San Francisco. Thèse
- Antoine Grigis : « Approches statistiques pour la détection de changements en IRM de diffusion. Application au suivi longitudinal de pathologies neuro-dégénératives » (septembre 2012, prix de thèse de l'Université de Strasbourg). Ingénieur-chercheur (CDI) au CEA (centre Neurospin). Thèse
- Gil Gaullier : « Modèles déformables contraints en reconstruction d'images de tomographie non linéaire par temps d'arrivée » (septembre 2013). Ingénieur de recherche CEA-Leti Thèse
- Mickael Ohana : « Imagerie de la ventilation par tomodensitométrie double énergie simple source avec inhalation de gaz noble » (juin 2016). PU-PH Radiologie - Imagerie cardio-vasculaire et thoracique, Hôpitaux Universitaires de Strasbourg. Thèse
- Alix Bouchon : « Modèles de régression multivariés pour la comparaison de populations en IRM de diffusion » (septembre 2016). Ingénieur Sogeti, Strasbourg. Thèse
- Florian Tilquin : « Statistical Models on Manifolds for Anomaly Detection on Medical Images » (novembre 2019). Machine Learning Engineer, Biosency (CDI), Rennes. Thèse
- Farid Ouhmich: "New radiomics approaches for hepatic tumor characterization through imaging analysis" (juin 2021). Data scientist chez Orthogrid, Strasbourg. Thèse
- Argheesh Bhanot: « Apprentissage par dictionnaire pour la séparation de sources sous contraintes spatiales » (juillet 2021). Post-doctorat GIPSA-lab, Grenoble. Thèse
- Romel Bhattacharjee: "Deformable Registration of Abdominal Images". PhD Indian Institute of Technology IIT, Banaras Hindu University, Varanasi (sept. 2021). Analyst (Engineer in Technology Research & Advisory), Aranca, Mumbai, Maharashtra, India Pub