Yves Michels
Doctorant
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Sujet de thèse
Reconstruction tomographique pour la cryo-microscopie électronique d'objets déformables
Financement: ANR RHODES.
Directeur: Mohamed TAJINE.
Co-directeur: Loic MAZO.
Encadrant: Etienne BAUDRIER.
La tomographie permet de reconstituer un objet (2D ou 3D) à partir d’un ensemble de projections de cet objet selon différents angles. Elle est notamment utilisée dans les scanners médicaux. Dans ce cas, l’angle correspondant à chaque projection est connu et utilisé pour la reconstruction de l’objet. Dans certaines applications (dont la cryo- tomographie électronique), les projections sont acquises sans avoir d’information sur les angles de projection correspondant. Ce cas de figure a été largement étudié sans pour autant aboutir à une solution universelle. En particulier, le cas (réel) de reconstruction d’objets déformables fait l’objet de recherche actives (notamment dans l’équipe Architecture des systèmes nucléoprotéiques par microscopie électronique 3-D de P.Schultz, IGBMC, avec laquelle on collabore). C’est un enjeu important car de nombreux objets étudiés actuellement par la tomographie sont en fait déformables. Le cas de la tomographie où les projections sont orientées est déjà bien traité, mais le cas (qui nous intéresse) où leurs orientations ne sont pas connues est traité actuellement par raffinement à partir d’une première reconstruction de l’objet. L'estimation des paramètres repose sur la réduction de dimension.
Mots clés
- Réduction de dimension
- Isomap
- Graphe de diffusion
- Tomographie
- Estimation de paramètres
Publication
2015
- M.Guillaume, Y.Michels, S.Jay Joint estimation of water column parameters and seabed reflectance combining maximum likelihood and unmixing algorithm 7th Workshop on Hyperspectral Image and Signal Processing: Evolution in Remote Sensing (WHISPERS). June2015