Yves Michels
Doctorant
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Activités
Doctorat
Reconstruction tomographique d'objets déformables pour la cryo-microscopie électronique à particules isolées
Financement: ANR RHODES.
Directeur: Mohamed TAJINE.
Encadrant: Loic MAZO.
Encadrant: Etienne BAUDRIER.
Cette thèse s'inscrit dans le projet RHODES dont l’objectif est l'amélioration des méthodes de reconstruction tomographiques ab initio d'objets déformables. La tomographie permet de construire un modèle d'un objet donné (en 2D ou en 3D) à partir d'un ensemble de projections de cet objet prises sous différentes orientations. Dans le cadre des travaux, l'objet est continûment déformable, et, pour chaque projection, le niveau de déformation et l'orientation sont inconnus. Ces travaux ont pour but d'être appliqués dans le cadre de la cryo-microscopie électronique à particules isolées où les projections sont fortement dégradées par du bruit. Les objectifs de la thèse sont l'estimation des paramètres d'orientation et de déformation et la construction de modèles déformable à partir de l'ensemble des données sans connaissances a priori sur l'objet imagé. Les méthodes d'estimation des paramètres proposées reposent sur la réduction de dimension non-linéaire, dont le but est de représenter les données (projections) dans un espace de faible dimension dans lequel les paramètres sont aisément estimables.
Axes de recherche :
L'étude sur la séparation des paramètres d'orientation et de déformation par réduction de dimension dans le cas d'objets planaires a fait l'objet d'un article présenté à la conférence ICIP 2016 (Phoenix).
La détection des courts circuits dans le graphe de voisinage fut le thème principal de l'année 2016 au cours de laquelle une méthode de détection basée sur la construction d'un graphe parcimonieux approximant la variété a été développée. L'approche a été présentée à la journée des nouveaux entrants 2016 de l'école doctorale MSII, et a été présenté lors de la session poster des Journées du Campus d'Illkirch du 28/03/2017.
Mots clés - Réduction de dimension, détection de courts-circuits, Estimation de densité, Estimation de paramètres, Tomographie
Projet de fin d'étude
Vidéo-stéganalyse basée sur l'étude des vecteurs de déplacement
Encadrant: Ahmed BOURIDANE.
Étude statistique des vecteurs de déplacement utilisés dans le standard H.264 conduisant au développement d'une méthode novatrice de détection des vidéos stéganographiques basée sur la morphologie des cartes de vecteur de déplacement. Ces travaux seront présentés lors du séminaire MIV du 14 janvier 2016.
Mots clés - H.264, Stéganographie, mathématiques morphologiques, SVM
Projet académique
Reconstruction en microscopie STORM
Développement et implémentation, en C d'un algorithme de reconstruction STORM.
Mots clés - Microscopie STORM, Détection de particules, Maximum de vraisemblance, Recalage d'images
Publication
<anyweb> https://icube-publis.unistra.fr/?author=Yves%20Michels </anyweb>
2015
- M.Guillaume, Y.Michels, S.Jay Joint estimation of water column parameters and seabed reflectance combining maximum likelihood and unmixing algorithm 7th Workshop on Hyperspectral Image and Signal Processing: Evolution in Remote Sensing (WHISPERS). June2015