Équipe IMAGeS : Images, Modélisation, Apprentissage, Géométrie et Statistique

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'''Reconstruction tomographique pour la cryo-microscopie électronique d'objets déformables'''
 
'''Reconstruction tomographique pour la cryo-microscopie électronique d'objets déformables'''
  
'''Financement''':  [http://www.agence-nationale-recherche.fr/?Projet=ANR-14-CE27-0012].
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'''Financement''':  [http://www.agence-nationale-recherche.fr/?Projet=ANR-14-CE27-0012 ANR RHODES].
  
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'''Directeur''': [http://dpt-info.u-strasbg.fr/~tajine/ Mohamed TAJINE].
  
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'''Co-directeur''': [http://icube-miv.unistra.fr/fr/index.php/Loic_Mazo Loic MAZO].
  
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'''Encadrant''': [http://icube-miv.unistra.fr/fr/index.php/Etienne_Baudrier Etienne BAUDRIER].
  
 
La tomographie permet de reconstituer un objet (2D ou 3D) à partir d’un ensemble de projections de cet objet
 
La tomographie permet de reconstituer un objet (2D ou 3D) à partir d’un ensemble de projections de cet objet

Version du 7 janvier 2016 à 15:45

Doctorant

ICube - MIV
300 Bd Sébastien Brant
BP 10413
67412 Illkirch CEDEX - France


Fax : + 33 (0) 3 68 85 44 52
Bureau : C226

Courriel : yves.michels(at)centrale-marseille(dot)fr

PhotoYvesMichels.jpg

Sujet de thèse

Reconstruction tomographique pour la cryo-microscopie électronique d'objets déformables

Financement: ANR RHODES.

Directeur: Mohamed TAJINE.

Co-directeur: Loic MAZO.

Encadrant: Etienne BAUDRIER.

La tomographie permet de reconstituer un objet (2D ou 3D) à partir d’un ensemble de projections de cet objet selon différents angles. Elle est notamment utilisée dans les scanners médicaux. Dans ce cas, l’angle correspondant à chaque projection est connu et utilisé pour la reconstruction de l’objet. Dans certaines applications (dont la cryo- tomographie électronique), les projections sont acquises sans avoir d’information sur les angles de projection correspondant. Ce cas de figure a été largement étudié sans pour autant aboutir à une solution universelle. En particulier, le cas (réel) de reconstruction d’objets déformables fait l’objet de recherche actives (notamment dans l’équipe Architecture des systèmes nucléoprotéiques par microscopie électronique 3-D de P.Schultz, IGBMC, avec laquelle on collabore). C’est un enjeu important car de nombreux objets étudiés actuellement par la tomographie sont en fait déformables. Le cas de la tomographie où les projections sont orientées est déjà bien traité, mais le cas (qui nous intéresse) où leurs orientations ne sont pas connues est traité actuellement par raffinement à partir d’une première reconstruction de l’objet. L'estimation des paramètres repose sur la réduction de dimension.

Schéma de la construction d'un sinogramme déformable.

Mots clés

  • Réduction de dimension
  • Isomap
  • Graphe de diffusion
  • Tomographie
  • Estimation de paramètres


Michels (discussion)