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| | | ICube - MIV<br /> 300 Bd Sébastien Brant<br /> BP 10413<br /> 67412 Illkirch CEDEX - France <br /><br /> Tel : + 33 (0) 3 68 85 44 52<br /> Bureau : '''B224''' <br /> | | | ICube - MIV<br /> 300 Bd Sébastien Brant<br /> BP 10413<br /> 67412 Illkirch CEDEX - France <br /><br /> Tel : + 33 (0) 3 68 85 44 52<br /> Bureau : '''B224''' <br /> |
| − | Courriel : '''jb(dot)courbot(at)unistra.fr'''<br />Page personelle : '''http://icube-miv.unistra.fr/fr/index.php/Jean-Baptiste_Courbot'''<br /> | + | Courriel : '''jb(dot)courbot(at)unistra.fr'''<br />Page personelle : '''http://www.jb-courbot.fr/'''<br /> |
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| − | == Description des activités ==
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| − | Mes travaux portent sur l'élaboration et l'application de méthodes pour la segmentation et la détection statistiques.
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| − | === Imagerie astronomique ===
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| − | Je suis actuellement doctorant sous la direction de [[Christophe Collet]], co-dirigé par Roland Bacon ([http://cral.univ-lyon1.fr/?lang=fr CRAL], Lyon), encadré par [[Vincent Mazet]] et [http://www-public.it-sudparis.eu/~monfrini/ Emmanuel Monfrini].
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| − | Sujet de thèse : '''Détection de signaux à faible SNR : application aux données hyperspectrales astronomiques du spectro-imageur MUSE.'''
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| − | Cette thèse s'inscrit dans le projet [http://muse.univ-lyon1.fr/ MUSE] et plus précisément dans l'ERC MUSICOS, dédiée à l'étude de la formation des galaxies. Le télescope MUSE est un instrument de deuxième génération pour le VLT, qui est entré en fonctionnement à l'automne 2014 (cf. [http://www.youtube.com/watch?v=e5TopF7DGMg vidéo explicative] de R.Bacon).
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| − | L'objectif de la thèse est de permettre la détection et la classification d'éléments très ténus dans les données issues de MUSE. Ces éléments sont principalement du gaz circum-galactique et inter-galactique, dont on ne dispose à l'heure actuelle d'aucune observation directe. Elles permettront une meilleure compréhension de l'environnement et de la formation des jeunes galaxies.
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| − | [[Fichier:Hdfs top s.png|750px|vignette|centre|Premiers résultats de détection de halo circum-galactique (contours) autour d'émetteurs de Lyman (représentés en étoiles) dans un cube MUSE (fond). La couleur des contours représente le redshift des objets. ]]
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| − | === Imagerie médicale ===
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| − | [[Fichier:Courbot L5 T1 seg.png|300px|vignette|droite|Illustration d'un résultat de segmentation des vertèbres lombaires et thoraciques. ]]
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| − | Mon stage de fin d'étude ( [http://icube-miv.unistra.fr/fr/img_auth.php/6/66/2014_SujetStage_Imagerie_m%C3%A9dical.pdf sujet] ) a eu pour principal objet la segmentation vertébrale. J'ai pu y développer une nouvelle méthode de segmentation, valide sur tous types de vertèbres (lombaires, thoraciques, cervicales) ainsi que sur des cas particuliers, pathologiques notamment. Ces travaux ont fait l'objet d'un [[Séminaire_du_16/10/2014,_14h00|séminaire]] en octobre 2014.
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| − | [[Fichier:Courbot illu seg L3.gif|400px|vignette|centre|Illustration d'un résultat de segmentation vertébrale pour une vertèbre L3. ]]
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| − | J'ai par ailleurs pu mettre au point un prototype d'atlas vertébral, portant sur les volumes vertébraux et les positions et orientations relatives des vertèbres.
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| − | [[Fichier:Courbot atlas vert L3.png|250px|centre|vignette|Vues en coupes et 3D d'un volume moyen de l'atlas vertébral. ]]
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| − | === Traitement Automatique du Langage ===
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| − | Je me suis également intéressé à l'étiquetage morpho-syntaxique, qui vise à catégoriser les mots d'un texte écrit. La classification par Chaîne de Markov Cachée est très efficace dans ce contexte, et j'ai étudié en quoi des modèles par chaîne plus riche sont efficaces pour cette tâche.
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| − | == Encadrement ==
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| − | * Stage M2 MITI, INPG (Grenoble). Anthony Coradin : ''Recalage vertébral articulaire 3D'', co-encadrement Christophe Collet, Edmond Rust (2015)
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| − | * PFE, Télécom SudParis (Évry). Clément Besnier : '' Étiquetage morpho-syntaxique'', co-encadrement Emmanuel Monfrini (2015).
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| − | * TD de statistiques, TD de traitement du signal, 2ème année généraliste, Télécom Physique Strasbourg (2015-2016).
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| − | * TD de probabilités, 1ère année généraliste, Télécom Physique Strasbourg (2015-2016).
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| − | == Communications ==
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| − | === Présentations ===
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| − | * '' The MUSE Instrument for Lyman-alpha Haloe Detection'', [http://astro.unistra.fr/recherche/seminaires-et-reunions/seminaires-hebdomadaires/seminaire-hebdomadaire/?tx_ttnews%5Btt_news%5D=12468&cHash=e1c2d4f262280d16fee9e7318f56db9c séminaire de l'Observatoire de Strasbourg], 4 mars 2016.
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| − | * '' MUSE : les observations astronomiques et leur traitement'', [http://samovar.telecom-sudparis.eu/spip.php?article883&lang=fr Séminaire TIPIC], 25 février 2016.
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| − | * ''Statistical Modeling For Automatic Vertebra Segmentation'', [http://web.cs.uh.edu/~cosine/cosine5.html 5th Annual International Conference in Computational Surgery and Dual Training (Cosine)], Bethesda, MD, USA, 21 janvier 2015.
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| − | * ''Segmentation vertébrale coarse-to-fine et markovienne'', [http://icube-miv.unistra.fr/fr/index.php/S%C3%A9minaire_du_16/10/2014,_14h00 Séminaire MIV], 16 octobre 2014.
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