Jean-Baptiste Courbot

Doctorant

ICube - MIV 300 Bd Sébastien Brant BP 10413 67412 Illkirch CEDEX - France Tel : + 33 (0) 3 68 85 44 52 Bureau : B224 Courriel : jb(dot)courbot(at)unistra.fr Page personelle : http://icube-miv.unistra.fr/fr/index.php/Jean-Baptiste_Courbot

Description des activités

Mes travaux portent sur l'élaboration et l'application de méthodes pour la segmentation et la détection statistiques.

Imagerie astronomique

Je suis actuellement doctorant sous la direction de Christophe Collet, co-dirigé par Roland Bacon (CRAL, Lyon), encadré par Vincent Mazet et Emmanuel Monfrini.

Sujet de thèse : Détection de signaux à faible SNR : application aux données hyperspectrales astronomiques du spectro-imageur MUSE.

Cette thèse s'inscrit dans le projet MUSE et plus précisément dans l'ERC MUSICOS, dédiée à l'étude de la formation des galaxies. Le télescope MUSE est un instrument de deuxième génération pour le VLT, qui est entré en fonctionnement à l'automne 2014 (cf. vidéo explicative de R.Bacon).

L'objectif de la thèse est de permettre la détection et la classification d'éléments très ténus dans les données issues de MUSE. Ces éléments sont principalement du gaz circum-galactique et inter-galactique, dont on ne dispose à l'heure actuelle d'aucune observation directe. Elles permettront une meilleure compréhension de l'environnement et de la formation des jeunes galaxies.

Premiers résultats de détection de halo circum-galactique (contours) autour d'émetteurs de Lyman (représentés en étoiles) dans un cube MUSE (fond). La couleur des contours représente le redshift des objets.

Imagerie médicale

Illustration d'un résultat de segmentation des vertèbres lombaires et thoraciques.

Mon stage de fin d'étude ( sujet ) a eu pour principal objet la segmentation vertébrale. J'ai pu y développer une nouvelle méthode de segmentation, valide sur tous types de vertèbres (lombaires, thoraciques, cervicales) ainsi que sur des cas particuliers, pathologiques notamment. Ces travaux ont fait l'objet d'un séminaire en octobre 2014.

Illustration d'un résultat de segmentation vertébrale pour une vertèbre L3.

J'ai par ailleurs pu mettre au point un prototype d'atlas vertébral, portant sur les volumes vertébraux et les positions et orientations relatives des vertèbres.

Vues en coupes et 3D d'un volume moyen de l'atlas vertébral.

Traitement Automatique du Langage

Je me suis également intéressé à l'étiquetage morpho-syntaxique, qui vise à catégoriser les mots d'un texte écrit. La classification par Chaîne de Markov Cachée est très efficace dans ce contexte, et j'ai étudié en quoi des modèles par chaîne plus riche sont efficaces pour cette tâche.

Communications

Présentations

• The MUSE Instrument for Lyman-alpha Haloe Detection, [tt_news=12468&cHash=e1c2d4f262280d16fee9e7318f56db9c séminaire de l'Observatoire de Strasbourg], 4 mars 2016.

• MUSE : les observations astronomiques et leur traitement, Séminaire TIPIC, 25 février 2016.

• Statistical Modeling For Automatic Vertebra Segmentation, 5th Annual International Conference in Computational Surgery and Dual Training (Cosine), Bethesda, MD, USA, 21 janvier 2015.

• Segmentation vertébrale coarse-to-fine et markovienne, Séminaire MIV, 16 octobre 2014.

Encadrement

• Stage M2 MITI, INPG (Grenoble). Anthony Coradin : Recalage vertébral articulaire 3D, co-encadrement Christophe Collet, Edmond Rust (2015)

• PFE, Télécom SudParis (Évry). Clément Besnier : Étiquetage morpho-syntaxique, co-encadrement Emmanuel Monfrini (2015).

• TD de statistiques, TD de traitement du signal, 2ème année généraliste, Télécom Physique Strasbourg (2015-2016).

• TD de probabilités, 1ère année généraliste, Télécom Physique Strasbourg (2015-2016).

Publications

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