Fabrice Heitz

Professeur, Directeur-adjoint Icube

ICube - MIV 300 Bd Sébastien Brant BP 10413 67412 Illkirch CEDEX - France Tel : + 33 (0) 3 68 85 44 87 Fax : + 33 (0) 3 68 85 44 55 Bureau : C215 Courriel : fabrice(dot)heitz(at)unistra(dot)fr

Description des activités

Thématiques de recherche

• Traitement du signal et de l'image
• Modélisation statistique (images 3D+t), modèles markoviens et modèles non gaussiens, modèles d'apparence, modèles déformables
• Recalage rigide et déformable d'images multimodales, segmentation d'images 3D, suivi temporel 3D+t, détection de changements inter-images.
• Applications : imagerie médicale, analyse de séquences temporelles.

Encadrement de thèses

• Florent Savary. Comparaison patient - atlas de normalité en imagerie multimodale TEP / ITD. Application à la détection précoce et au suivi longitudinal dans la maladie d’Alzheimer. Université de Strasbourg. Co-direction de thèse avec I. Namer, PUPH, Service de Biophysique et de Médecine Nucléaire, Hôpitaux Universitaires de Strasbourg (à partir de décembre 2013). Financement : convention CIFRE, en cours.

• Alix Bouchon. Détection statistique de changements longitudinaux en imagerie IRM anatomique et de diffusion. Application au suivi de cohortes de patients. Co-encadrement avec Vincent Noblet et Jean-Paul Armspach (depuis octobre 2012). Financement : contrat doctoral UdS.

• Fabrice Hubele (MCUPH, Praticien Hospitalier, Service de biophysique et de médecine nucléaire, Hôpitaux Universitaires de Strasbourg). Approche multimodale médecine nucléaire (TEP) et Imagerie par Résonance Magnétique (IRM, DTI) dans l’étude des nouveaux traceurs de la plaque amyloïde (AV45, AV1 et PIB) et de l’extension des gliomes (F-DOPA, FDG). Co-direction de thèse avec I. Namer, PUPH, Service de Biophysique et de Médecine Nucléaire, Hôpitaux Universitaires de Strasbourg (depuis novembre 2011).

Enseignement

• Formations : Télécom Physique Strasbourg , Master Imagerie, Robotique, Ingénierie pour le Vivant.

• Cours :

TPS 1A : Introduction au traitement du signal (signaux analogiques)

TPS 1A : Probabilités et processus aléatoires

TPS 2A : Traitement numérique du signal, signaux aléatoires.

TPS 2A : Statistiques

TPS 2A : Traitement du signal 2D et traitement des images.

TPS 3A - Master IRIV : Analyse de séquences d'images.

Responsabilités collectives

• Directeur-adjoint du Laboratoire Icube, directeur du département IRTS (2013-)
• Directeur du LSIIT UMR 7005 CNRS / Université de Strasbourg (2005-2012)
• Membre élu du Conseil scientifique de l'Université de Strasbourg (2009-2012)
• Membre élu du conseil de l'ENSPS
• Expert AERES (président et membre de comité de visite), ANR, auprès du MESR (DSPT), Oseo-Anvar, ANRT, Région Alsace.
• Membre nommé du CNU 61ème section (2004-2007)
• Membre élu du conseil scientifique de l'ULP (chargé de mission STIC dans la section permanente, 1999-2006)
• Membre du comité de pilotage du GDR ISIS (2001-2004)
• Responsable du DEA "Photonique, Image, Cybernétique" ULP (1999-2005)
• Responsable du Pôle Image Région Alsace (CPER 1999-2004)
• Editeur associé de la revue IEEE Transactions on Image Processing (1996-1999)

Curriculum Vitae

• CV

Anciens doctorants

• Etienne Mémin : « Algorithmes et architectures parallèles pour les approches markoviennes en analyse d’images » (juin 1993). Directeur de Recherches INRIA (Centre INRIA Rennes), responsable de l’équipe-projet INRIA « Fluminance ».

• Patrick Perez : « Champs markoviens et analyse multirésolution de l’image : application à l’analyse du mouvement » (juillet 1993). Directeur de Recherches INRIA (centre INRIA Rennes). Technicolor Research Center (Rennes).

• Charles Kervrann : « Modèles statistiques pour la segmentation et le suivi de structures déformables bidimensionnelles dans une séquence d’images » (novembre 1995). Directeur de Recherches INRIA (Centre INRIA Rennes), responsable de l’équipe-projet « Serpico ».

• Jean-Marc Laferté : « Contribution à l’analyse d’images par modèles markoviens sur des graphes hiérarchiques. Application à la fusion de données multirésolutions » (octobre 1996). Enseignant–chercheur Département Génie logiciel et Techniques de l’Information à l'ECAM-Rennes.

• Christophoros Nikou : « Contribution au recalage d’images médicales multimodales : approches par fonctions de similarité robustes et modèles déformables physiques sous contraintes statistiques » (mai 1999). Assistant Professor, Computer Science Department, University of Ioannina, Grèce.

• Olivier Musse : « Contribution à la mise en correspondance non rigide d’images médicales : une approche paramétrique hiérarchique sous contraintes topologiques. Application au recalage déformable du cerveau en imagerie IRM » (décembre 2000). Project Manager, Thomson Grass Valley, Rennes.

• Raouf Hamdan : « Détection, suivi et reconnaissance des formes et du mouvement par modèles probabilistes d’apparence »(janvier 2001). Associate Professor à l’Université de Damas (Syrie).

• Rozenn Dahyot : « Reconnaissance des formes et indexation par le contenu de bases de données d’images séquentielles pour la gestion du réseau routier » (novembre 2001). Assistant Professor in Statistics, School of Computer Science and Statistics, Trinity College Dublin, Ireland. Thèse

• Michel Salomon : « Parallélisation d’algorithmes d’optimisation globale pour le recalage d’images par fonctions de similarité »(décembre 2001). Maître de Conférences, Université de Franche-Comté, Laboratoire d’Informatique de Franche-Comté. Thèse

• Marcel Bosc : « Détection de changements dans des séquences d’images médicales 3D multimodales. Application à la détection et au suivi des lésions de scléroses en plaques » (décembre 2003). Maître de Conférences, Université Paris 13, Laboratoire de Traitement et de Transport de l’Information (L2TI). Thèse

• Torbjorn Vik : « Modèles statistiques d’apparence 3D. Application à la création d’un atlas probabiliste de perfusion cérébrale pour l’aide au diagnostic » (décembre 2004). Ingénieur R&D, Philips, Hamburg. Thèse

• Sylvain Faisan : « Analyse et fusion markovienne de séquences en imagerie 3D+t. Application à l’analyse de séquences d’images IRM fonctionnelles cérébrales » (décembre 2004, prix de thèse de l'Université de Strasbourg). Maître de Conférences à Télécom Physique Strasbourg. Thèse

• Alban Foulonneau : « Une contribution à l’introduction de contraintes de forme dans les contours actifs orientés région » (décembre 2004). Maître de Conférences à l’Université de Haute Alsace, laboratoire MIPS Modélisation, Intelligence, Processus, Systèmes.

• Vincent Noblet : « Recalage non rigide d’images cérébrales 3D avec contrainte de conservation de la topologie » (mars 2006). Ingénieur de Recherche CNRS à ICube, Strasbourg. Thèse

• Matthieu Brucher : « Représentations compactes et apprentissage non supervisé de variétés non linéaires. Application au traitement d’images » (octobre 2008). HPC Developer at Total, Abingdon, Oxfordshire, Royaume-Uni. Thèse

• Hervé Boisgontier : « Détection automatique de changements en IRM de diffusion. Application à l’étude longitudinale de patients atteints de sclérose en plaques » (juillet 2010). Formateur en Informatique CDI, ENI Nantes. Thèse

• Swati Sharma : « Recalage déformable d'images médicales 3D multi-modales. Application à la mesure de l’atrophie cérébrale dans la sclérose en plaques » (septembre 2011). Associate professor, DeVry university, Chicago, USA. Thèse

• Antoine Grigis : « Détection statistique de changements en IRM du tenseur de diffusion. Application à la détection précoce de l’évolution des tumeurs cérébrales et des lésions de sclérose en plaques » (septembre 2012, prix de thèse de l'Université de Strasbourg). Ingénieur-chercheur (CDI) au CEA. (centre Neurospin) Thèse

• Gil Gaullier : « Modèles déformables contraints en reconstruction d'images de tomographie non linéaire par temps d'arrivée » (septembre 2013).

Publications

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