Équipe IMAGeS : Images, Modélisation, Apprentissage, Géométrie et Statistique

Différences entre les versions de « Analyse statistique et problèmes inverses »

De Équipe IMAGeS : Images, Modélisation, Apprentissage, Géométrie et Statistique
Aller à la navigation Aller à la recherche
 
(34 versions intermédiaires par 2 utilisateurs non affichées)
Ligne 1 : Ligne 1 :
Responsable : [[Fabrice Heitz]]
+
''Responsable'' : [[Erik-André Sauleau]]
 +
 
 +
<br />
 +
 
 +
''Participants permanents'' : C. Collet, S. Faisan, C. Heinrich, F. Heitz, V. Mazet, N. Meyer, V. Noblet, F. Rousseau, E.-A. Sauleau, L. Thoraval
 +
<br />
 +
''Doctorants (thèses en cours)'' : A. Bouchon, F. Séverac.
 +
 
  
 
Ce thème s'intéresse à l’ensemble des approches méthodologiques basées sur l’utilisation des statistiques et des outils associés à l’inférence bayésienne pour l’analyse d'images et la résolution de problèmes inverses. L'objectif est le développement de modèles, de méthodes d'inférence et d'algorithmes originaux, dans un contexte générique, ou dans le cadre d'applications particulières. Les problèmes traités incluent la reconstruction, le recalage, la segmentation, la détection, la classification, la fusion, et la visualisation des signaux et des images au sens large, incluant les observations multivariées ou multimodales.
 
Ce thème s'intéresse à l’ensemble des approches méthodologiques basées sur l’utilisation des statistiques et des outils associés à l’inférence bayésienne pour l’analyse d'images et la résolution de problèmes inverses. L'objectif est le développement de modèles, de méthodes d'inférence et d'algorithmes originaux, dans un contexte générique, ou dans le cadre d'applications particulières. Les problèmes traités incluent la reconstruction, le recalage, la segmentation, la détection, la classification, la fusion, et la visualisation des signaux et des images au sens large, incluant les observations multivariées ou multimodales.
Ligne 17 : Ligne 24 :
 
<br />
 
<br />
  
* [http://scd-theses.u-strasbg.fr/886/01/Faisan2004.pdf Modèles markoviens cachés de séquences d'événements. Application à la cartographie IRMf cérébrale.]  
+
* Modèles markoviens cachés de séquences d'événements. Application à la cartographie IRMf cérébrale. [http://scd-theses.u-strasbg.fr/886/01/Faisan2004.pdf Sylvain Faisan]. [http://dx.doi.org/10.1016/j.media.2006.09.003 Article 1]. [http://dx.doi.org/10.1016/j.acra.2004.09.012 Article 2.]  
  
* Modèles de Markov cachés. [http://lsiit-miv.u-strasbg.fr/lsiit/perso/collet/ftp/PhD/PhD_LeCam.pdf Application à l'analyse temps-fréquence des sons respiratoires pour l'identification de signatures pulmonaires.]
+
* [http://dx.doi.org/10.1016/j.patrec.2012.03.009 Comparaison entre un sujet et un modèle statistique.] Application à la détection d'anomalies en chirurgie maxillo-faciale. Sylvain Faisan.
  
* Chaînes de Markov 3D+t. [http://icube-miv.unistra.fr/fr/index.php/Fran%C3%A7ois_Lavigne Application à la segmentation statistique 3d+t d’images IRM multimodales pour la quantification de la charge lésionnelle.]
+
* Modèles de Markov cachés. [http://lsiit-miv.u-strasbg.fr/lsiit/perso/collet/ftp/PhD/PhD_LeCam.pdf Application à l'analyse temps-fréquence des sons respiratoires pour l'identification de signatures pulmonaires.] Thèse Steven Le Cam.
 +
 
 +
* Modèles de Markov cachés. Application à la segmentation d'IRM 3D et à la détection de lésions. [http://scd-theses.u-strasbg.fr/1651/01/BRICQ_Stephanie_2008-protege.pdf]. Thèse Stéphanie Bricq [http://dx.doi.org/10.1016/j.media.2008.03.001 Article].
 +
 
 +
* Chaînes de Markov 3D+t. Application à la segmentation statistique 3d+t d’images IRM multimodales pour la quantification de la charge lésionnelle. <span style="color:red">Thèse en cours : François Lavigne.</span>
  
 
=== Modèles graphiques, modèles bayésiens hiérarchiques ===
 
=== Modèles graphiques, modèles bayésiens hiérarchiques ===
Ligne 36 : Ligne 47 :
 
<br />
 
<br />
  
* Modèles graphiques. Application à la détection de changements du bâti en imagerie de télédétection multibande et hyperspectrale.
+
* Modèles graphiques. Application à la détection de changements du bâti en imagerie de télédétection multibande et hyperspectrale. <span style="color:red">Thèse en cours : Thanh Ngo.</span>
  
=== Modèles non linéaires compacts ===
+
=== Modèles non linéaires compacts. Apprentissage de variétés ===
  
 
[[File:swissroll.png|frameless|left|380px]]
 
[[File:swissroll.png|frameless|left|380px]]
Ligne 50 : Ligne 61 :
 
<br />
 
<br />
  
* Modèles à variables latentes : modèles d'observations non gaussiens et modèles non linéaires dans l'espace réduit : [http://dx.doi.org/10.1007/s10044-004-0230-5 Article 1], [http://dx.doi.org/10.1109/TPAMI.2007.1028 Article 2].
+
* Modèles à variables latentes : modèles d'observations non gaussiens et modèles non linéaires dans l'espace réduit : [http://scd-theses.u-strasbg.fr/881/01/VIK2004.pdf Thèse Vik Torbjorn]. [http://dx.doi.org/10.1007/s10044-004-0230-5 Article 1], [http://dx.doi.org/10.1109/TPAMI.2007.1028 Article 2].
 +
 
 +
* Apprentissage statistique de variétés non linéaires : une approche par MDS. [http://scd-theses.u-strasbg.fr/1565/01/BRUCHER_Matthieu_2008.pdf Thèse Matthieu Brucher]. [http://asp.eurasipjournals.com/content/pdf/1687-6180-2008-862015.pdf Article].
 +
 
 +
* [http://scd-theses.u-strasbg.fr/2461/01/RENARD_Felix_2011.pdf Modèles non linéaires statistiques compacts pour des données de grande dimension. Application en neuro-imagerie : étude des formes, des structures, de la connectivité cérébrale. Thèse Félix Renard]
  
* Apprentissage statistique de variétés non linéaires : une approche par MDS. [http://scd-theses.u-strasbg.fr/1565/01/BRUCHER_Matthieu_2008.pdf Thèse]. [http://asp.eurasipjournals.com/content/pdf/1687-6180-2008-862015.pdf Article].
+
* Modèles non linéaires sur des espaces tensoriels. Application à la détection de changements en IRM de diffusion.] [https://publication-theses.unistra.fr/public/theses_doctorat/grigis_antoine_2012_ED269.pdf Thèse Antoine Grigis]. [http://dx.doi.org/10.1016/j.neuroimage.2012.02.049 Article 1]. [http://dx.doi.org/10.1016/j.media.2013.01.004 Article 2].
  
* [http://scd-theses.u-strasbg.fr/2461/01/RENARD_Felix_2011.pdf Modèles non linéaires statistiques compacts pour des données de grande dimension. Application en neuro-imagerie : étude des formes, des structures, de la connectivité cérébrale.]
+
* Modélisation de tenseurs d'ordre supérieur en IRM de diffusion. Application à la comparaison de populations et à l'extraction de biomarqueurs. <span style="color:red">Thèse en cours : Theodosios Gkamas.</span>
  
* Modèles non linéaires sur des espaces tensoriels. Application à la détection de changements en IRM de diffusion.] [https://publication-theses.unistra.fr/public/theses_doctorat/grigis_antoine_2012_ED269.pdf Thèse]. [http://dx.doi.org/10.1016/j.neuroimage.2012.02.049 Article 1]. [http://dx.doi.org/10.1016/j.media.2013.01.004 Article 2].
+
* Modèles statistiques linéaires / non linéaires pour les études de groupe en imagerie ITD. <span style="color:red">Thèse en cours : Alix Bouchon.</span>
  
 +
* Modélisation non linéaire compacte d'images multimodales TEP / ITD. Application à la comparaison patient-atlas de normalité. <span style="color:red">Thèse en cours : Florent Savary.</span>
  
 
== Problèmes inverses ==
 
== Problèmes inverses ==
Ligne 73 : Ligne 89 :
 
<br />
 
<br />
  
* [http://dx.doi.org/10.1016/j.media.2010.04.005 Super-résolution en imagerie IRM, intégrant un a priori multimodal]
+
* [http://dx.doi.org/10.1016/j.media.2010.04.005 Super-résolution en imagerie IRM, intégrant un a priori multimodal. François Rousseau.]
  
* [http://dx.doi.org/10.1109/TMI.2009.2030679 Reconstruction 3D en imagerie foetale in utero à partir de coupes IRM.]
+
* [http://dx.doi.org/10.1109/TMI.2009.2030679 Reconstruction 3D en imagerie foetale in utero à partir de coupes IRM. François Rousseau.]
  
* [http://dx.doi.org/10.1109/ICIP.2009.5413470 A priori de formes en reconstruction tomographique orientée objet.]  
+
* [http://dx.doi.org/10.1109/ICIP.2009.5413470 A priori de formes en reconstruction tomographique orientée objet. Thèse Gil Gaullier.]  
  
 
=== Imagerie polarimétrique ===
 
=== Imagerie polarimétrique ===
Ligne 91 : Ligne 107 :
 
<br />
 
<br />
  
* Inversion de données en imagerie polarimétrique : imagerie de Stockes, imagerie de Mueller, Non Local Means, inversion sous contrainte d'admissibilité. [http://dx.doi.org/10.1364/JOSAA.28.000465 Article 1]. [http://dx.doi.org/10.1364/JOSAA.29.002028 Article 2].  
+
* Inversion de données en imagerie polarimétrique : imagerie de Stockes, imagerie de Mueller, Non Local Means, inversion sous contrainte d'admissibilité. S. Faisan, C. Heinrich, J. Zallat. [http://dx.doi.org/10.1364/JOSAA.28.000465 Article 1]. [http://dx.doi.org/10.1364/JOSAA.29.002028 Article 2]. [http://dx.doi.org/10.1364/OE.21.004424 Article 3].
  
 
=== Signaux spectroscopiques ===
 
=== Signaux spectroscopiques ===
Ligne 104 : Ligne 120 :
 
<br />
 
<br />
 
<br />
 
<br />
* [http://lsiit-miv.u-strasbg.fr/lsiit/perso/collet/ftp/PhD/PhD_Gendrin.pdf Spectroscopie proche infra rouge et imagerie chimique non destructive. Application au contrôle de qualité dans l'industrie pharmaceutique.]  
+
* [http://scd-theses.u-strasbg.fr/1548/01/GENDRIN_Christelle_2008.pdf Spectroscopie proche infra rouge et imagerie chimique non destructive. Application au contrôle de qualité dans l'industrie pharmaceutique. Thèse Christelle Gendrin.]  
  
* [http://lsiit-miv.u-strasbg.fr/lsiit/perso/collet/ftp/PhD/PhD_Belghith.pdf Indexation de spectres HSQC et d'images IRMF appliquée à la détection de bio-marqueurs.]
+
* [https://publication-theses.unistra.fr/public/theses_doctorat/Belghith_Akram_2012_ED269.pdf Indexation de spectres HSQC et d'images IRMF appliquée à la détection de bio-marqueurs. Thèse Akram Belghith.]
  
* [http://lsiit-miv.u-strasbg.fr/mazet/spectrodec/index.html Décomposition conjointe de séquences de signaux spectroscopiques] : modèles bayésiens hiérarchiques, champ markoviens gaussiens, RJMCMC, spectroscopie de photoélectrons, radioastronomie.
+
* [http://lsiit-miv.u-strasbg.fr/mazet/spectrodec/index.html Décomposition conjointe de séquences de signaux spectroscopiques] : modèles bayésiens hiérarchiques, champ markoviens gaussiens, RJMCMC, spectroscopie de photoélectrons, radioastronomie. Vincent Mazet, Sylvain Faisan.
  
 
=== Imagerie hyperspectrale ===
 
=== Imagerie hyperspectrale ===
  
* [http://lsiit-miv.u-strasbg.fr/paseo/cubefusion.php Fusion bayésienne optimale de données hyperspectrales multi-observations  (2d+lambda+t).]
+
[[File:AstroHyperspectral.jpg|frameless|left|200px]]
 +
<br />
 +
<br />
 +
<br />
 +
<br />
 +
<br />
 +
<br />
 +
<br />
 +
<br />
 +
 
 +
* [http://lsiit-miv.u-strasbg.fr/paseo/cubefusion.php Fusion bayésienne optimale de données hyperspectrales multi-observations  (2d+lambda+t).] Christophe Collet.
  
* [http://lsiit-miv.u-strasbg.fr/paseo/cubedeconvolution.php Déconvolution de données astronomiques hyperspectrales.]
+
* [http://lsiit-miv.u-strasbg.fr/paseo/cubedeconvolution.php Déconvolution de données astronomiques hyperspectrales.] Vincent Mazet.
  
 
[[en:Statistical_analysis_and_inverse_problems]]
 
[[en:Statistical_analysis_and_inverse_problems]]

Version actuelle datée du 26 août 2016 à 10:44

Responsable : Erik-André Sauleau


Participants permanents : C. Collet, S. Faisan, C. Heinrich, F. Heitz, V. Mazet, N. Meyer, V. Noblet, F. Rousseau, E.-A. Sauleau, L. Thoraval
Doctorants (thèses en cours) : A. Bouchon, F. Séverac.


Ce thème s'intéresse à l’ensemble des approches méthodologiques basées sur l’utilisation des statistiques et des outils associés à l’inférence bayésienne pour l’analyse d'images et la résolution de problèmes inverses. L'objectif est le développement de modèles, de méthodes d'inférence et d'algorithmes originaux, dans un contexte générique, ou dans le cadre d'applications particulières. Les problèmes traités incluent la reconstruction, le recalage, la segmentation, la détection, la classification, la fusion, et la visualisation des signaux et des images au sens large, incluant les observations multivariées ou multimodales.


Modèles et décision statistique

Modèles markoviens

Chaine Markov.png








  • Modèles de Markov cachés. Application à la segmentation d'IRM 3D et à la détection de lésions. [1]. Thèse Stéphanie Bricq Article.
  • Chaînes de Markov 3D+t. Application à la segmentation statistique 3d+t d’images IRM multimodales pour la quantification de la charge lésionnelle. Thèse en cours : François Lavigne.

Modèles graphiques, modèles bayésiens hiérarchiques

Modele graphique.png










  • Modèles graphiques. Application à la détection de changements du bâti en imagerie de télédétection multibande et hyperspectrale. Thèse en cours : Thanh Ngo.

Modèles non linéaires compacts. Apprentissage de variétés

Swissroll.png









  • Modélisation de tenseurs d'ordre supérieur en IRM de diffusion. Application à la comparaison de populations et à l'extraction de biomarqueurs. Thèse en cours : Theodosios Gkamas.
  • Modèles statistiques linéaires / non linéaires pour les études de groupe en imagerie ITD. Thèse en cours : Alix Bouchon.
  • Modélisation non linéaire compacte d'images multimodales TEP / ITD. Application à la comparaison patient-atlas de normalité. Thèse en cours : Florent Savary.

Problèmes inverses

Imagerie médicale

Motion compensation.png









Imagerie polarimétrique

Poincare.png










  • Inversion de données en imagerie polarimétrique : imagerie de Stockes, imagerie de Mueller, Non Local Means, inversion sous contrainte d'admissibilité. S. Faisan, C. Heinrich, J. Zallat. Article 1. Article 2. Article 3.

Signaux spectroscopiques

Spectrum.png










Imagerie hyperspectrale

AstroHyperspectral.jpg