Fabrice Heitz
Révision datée du 21 août 2019 à 17:01 par Heitz (discussion | contributions) (→Anciens doctorants)
Professeur, Directeur-adjoint du Laboratoire ICube
Responsable de l'équipe IMAGeS
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Thématiques de recherche
- Traitement du signal et de l'image.
- Modélisation statistique (images 3D+t), modèles markoviens et modèles non gaussiens, modèles d'apparence, modèles déformables.
- Apprentissage (Machine Learning).
- Recalage rigide et déformable d'images multimodales, segmentation d'images 3D, suivi temporel 3D+t, détection de changements inter-images.
- Applications : imagerie médicale, analyse de séquences temporelles.
Enseignement
- Cours :
Encadrement de thèses
- [Guillaume Décor]. Reconnaissance des formes pour l’inspection des tunnels. Co-direction de thèse avec P. Charbonnier (DR CEREMA) (depuis octobre 2018).
- [Romel Bhattacharjee]. Fusion and Co-registration of Multimodal Medical Images. Co-direction de thèse avec S. Sharma (Associate Professor, Indian Institute of Technology IIT, Banaras Hindu University, Varanasi), (depuis septembre 2018).
- [Argheesh Bhanot]. Détection de changements multipoints en IRM multi-séquences du petit animal. Co-direction de thèse avec L. Harsan (MCU-PH, HDR), encadrement C. Meillier, MCF (depuis octobre 2017).
- [Farid Ouhmich]. Nouvelles approches radiomiques pour la caractérisation de tumeurs hépatiques par analyse d’images. Co-direction de thèse avec V. Noblet, IR CNRS HDR (depuis octobre 2017).
- [Florian Tilquin]. Modèles statistiques non linéaires sur des variétés en imagerie multimodale TEP/IRM/ITD. Application à la détection précoce et au suivi longitudinal dans la maladie d’Alzheimer. Co-direction de thèse avec I. Namer, PUPH, Service de Biophysique et de Médecine Nucléaire, Hôpitaux Universitaires de Strasbourg (depuis octobre 2016).
Responsabilités collectives
- Responsable de l'équipe IMAGeS ICube (2016-)
- Directeur-adjoint du Laboratoire ICube, directeur du département IRTS (2013-)
- Directeur du LSIIT UMR 7005 CNRS / Université de Strasbourg (2005-2012)
- Membre élu du Conseil scientifique de l'Université de Strasbourg (2009-2012)
- Membre élu du conseil de Télécom Physique Strasbourg
- Expert AERES / HCERES (président et membre de comité de visite), ANR, auprès du MESR (DSPT), Oseo-Anvar, ANRT, Région Alsace.
- Membre nommé du CNU 61ème section (2004-2007)
- Membre élu du conseil scientifique de l'ULP (chargé de mission STIC dans la section permanente, 1999-2006)
- Membre du comité de pilotage du GDR ISIS (2001-2004)
- Responsable du DEA "Photonique, Image, Cybernétique" ULP (1999-2005)
- Responsable du Pôle Image Région Alsace (CPER 1999-2004)
- Editeur associé de la revue IEEE Transactions on Image Processing (1996-1999)
Curriculum Vitae
Anciens doctorants
- Etienne Mémin : « Algorithmes et architectures parallèles pour les approches markoviennes en analyse d’images » (juin 1993). Directeur de Recherches INRIA (Centre INRIA Rennes), responsable de l’équipe-projet INRIA « Fluminance ».
- Patrick Perez : « Champs markoviens et analyse multirésolution de l’image : application à l’analyse du mouvement » (juillet 1993). Directeur de Recherches INRIA (centre INRIA Rennes). Directeur de valeo.ai (Valeo AI research lab).
- Charles Kervrann : « Modèles statistiques pour la segmentation et le suivi de structures déformables bidimensionnelles dans une séquence d’images » (novembre 1995). Directeur de Recherches INRIA (Centre INRIA Rennes), responsable de l’équipe-projet « Serpico ».
- Jean-Marc Laferté : « Contribution à l’analyse d’images par modèles markoviens sur des graphes hiérarchiques. Application à la fusion de données multirésolutions » (octobre 1996). Enseignant–chercheur Département Génie logiciel et Techniques de l’Information à l'ECAM-Rennes.
- Christophoros Nikou : « Contribution au recalage d’images médicales multimodales : approches par fonctions de similarité robustes et modèles déformables physiques sous contraintes statistiques » (mai 1999). Associate Professor, Computer Science Department, University of Ioannina, Grèce.
- Olivier Musse : « Contribution à la mise en correspondance non rigide d’images médicales : une approche paramétrique hiérarchique sous contraintes topologiques. Application au recalage déformable du cerveau en imagerie IRM » (décembre 2000). Project Manager, Thomson Grass Valley, Rennes.
- Raouf Hamdan : « Détection, suivi et reconnaissance des formes et du mouvement par modèles probabilistes d’apparence »(janvier 2001). Associate Professor, Arab International University, Syria.
- Rozenn Dahyot : « Reconnaissance des formes et indexation par le contenu de bases de données d’images séquentielles pour la gestion du réseau routier » (novembre 2001). Assistant Professor in Statistics, School of Computer Science and Statistics, Trinity College Dublin, Ireland. Thèse
- Michel Salomon : « Parallélisation d’algorithmes d’optimisation globale pour le recalage d’images par fonctions de similarité »(décembre 2001). Maître de Conférences, Université de Franche-Comté, Laboratoire d’Informatique de Franche-Comté. Thèse
- Marcel Bosc : « Détection de changements dans des séquences d’images médicales 3D multimodales. Application à la détection et au suivi des lésions de scléroses en plaques » (décembre 2003). Maître de Conférences, Université Paris 13, Laboratoire de Traitement et de Transport de l’Information (L2TI). Thèse
- Torbjorn Vik : « Modèles statistiques d’apparence 3D. Application à la création d’un atlas probabiliste de perfusion cérébrale pour l’aide au diagnostic » (décembre 2004). Senior Scientist, Philips, Eindhoven, Netherlands. Thèse
- Sylvain Faisan : « Analyse et fusion markovienne de séquences en imagerie 3D+t. Application à l’analyse de séquences d’images IRM fonctionnelles cérébrales » (décembre 2004, prix de thèse de l'Université de Strasbourg). Maître de Conférences à Télécom Physique Strasbourg. Thèse
- Alban Foulonneau : « Une contribution à l’introduction de contraintes de forme dans les contours actifs orientés région » (décembre 2004). Maître de Conférences à l’Université de Haute Alsace, laboratoire MIPS Modélisation, Intelligence, Processus, Systèmes.
- Vincent Noblet : « Recalage non rigide d’images cérébrales 3D avec contrainte de conservation de la topologie » (mars 2006). Ingénieur de Recherche CNRS à ICube, Strasbourg. Thèse
- Matthieu Brucher : « Représentations compactes et apprentissage non supervisé de variétés non linéaires. Application au traitement d’images » (octobre 2008). HPC Developer at Total, Abingdon, Oxfordshire, Royaume-Uni. Thèse
- Hervé Boisgontier : « Détection automatique de changements en IRM de diffusion. Application à l’étude longitudinale de patients atteints de sclérose en plaques » (juillet 2010). Enseignant en Informatique CDI, ENI Nantes. Thèse
- Swati Sharma : « Recalage déformable d'images médicales 3D multi-modales. Application à la mesure de l’atrophie cérébrale dans la sclérose en plaques » (septembre 2011). Associate professor, DeVry university, Chicago, USA. Thèse
- Antoine Grigis : « Approches statistiques pour la détection de changements en IRM de diffusion. Application au suivi longitudinal de pathologies neuro-dégénératives » (septembre 2012, prix de thèse de l'Université de Strasbourg). Ingénieur-chercheur (CDI) au CEA (centre Neurospin). Thèse
- Gil Gaullier : « Modèles déformables contraints en reconstruction d'images de tomographie non linéaire par temps d'arrivée » (septembre 2013). Post-doctorant (Laboratoire de Mathématiques Appliquées, UTC, Compiègne). Thèse
- Mickael Ohana : « Imagerie de la ventilation par tomodensitométrie double énergie simple source avec inhalation de gaz noble » (juin 2016). Praticien Hospitalier, radiologue, Hôpitaux Universitaires de Strasbourg. Post-doctorat au Canada. Thèse
- Alix Bouchon : « Modèles de régression multivariés pour la comparaison de populations en IRM de diffusion » (septembre 2016). Thèse
Publications
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