Différences entre les versions de « Etienne Baudrier »
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| 2018 || Romain PERRIN|| stage 150h || M2 || Utilisation de DGtal pour l’évaluation des estimateurs avec le dual suite | | 2018 || Romain PERRIN|| stage 150h || M2 || Utilisation de DGtal pour l’évaluation des estimateurs avec le dual suite |
Version du 17 janvier 2019 à 16:12
Maître de conférences
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Activité de recherche
Thèmes de recherche actifs:
- Géométrie discrète
- Estimateurs discrets (longueur)
- Discrétisations
- Enumération ((m,n)-cubes)
- Tomographie
- propriétés géométriques sans reconstruction
- reconstruction tridimensionnelle de macromolécules en microscopie électronique
Anciens thèmes de recherche
- Morphologie mathématique
- dans le cadre multidimensionnel
- Analyse multirésolution non-linéaire basée sur des opérateurs provenant des mathématiques morphologiques
- Algèbres géométriques pour l'image (wiki)
- Comparaison d'images binaires
- Mesure locale de dissimilarités
- Qualité des images
Code
- Tomographie : mesure de distance inter projection (developpée par MS Phan et décrite ici) disponible sur le git unistra : https://git.unistra.fr/msphan/MADE
Rapporteur externe pour les journaux et conférences suivants
Computer Vision and Image Understanding (CVIU, Elsevier), J Mathematical Imaging and Vision (JMIV, Elsevier), Pattern Recognition Letters (PRL, Elsevier), Innovation and Research in BioMedical Engineering (IRBM, Elsevier), Discrete Geometry for Computer Imagery int conf (DGCI), IEEE Int Symp on Biomedical Imaging (ISBI), int conf on Computer Analysis of Images and Patterns (CAIP), Int Conf on Document Analysis and Recognition (ICDAR).
Projets de recherche
En cours
- RHODES (2015-2018) Reconstruction tomograpHique pour la cryo-micrOscopie électronique d'objets DéformablES, projet ANR Jeunes chercheurs
Anciens
- OTOMAN, projet inter-équipes (ICPS,SDC,MIV) interne au laboratoire ICube 2016
- KIDICO (2011-2014) Intégration des connaissances pour la convolution discrète, la segmentation et la reconstruction d'informations dans les images digitales, projet ANR blanc
- DEFCON, projet inter-équipes interne au laboratoire ICube 2014
- TomoMicro (2012-2013), Projet Exploratoire Pluridisciplinaire Biologie Mathématique Informatique (PEPS BMI) du CNRS sur la reconstruction tomographique pour la cryo-microscopie électronique
Encadrement
Proposition de stage
Stage de M2 : Accélération et amélioration d'une méthode de reconstruction tomographique sujet, video d'une reconstruction : https://seafile.unistra.fr/f/474f667d25/
Thèses en cours
2018-2021 | Etienne LE QUENTREC | co-encadrement avec Pr. Mohamed TAJINE et Loïc MAZO | Théorie de la mesure et estimateurs en géométrie discrète |
Thèses soutenues
2015-2018 | Yves MICHELS | co-encadrement avec Pr. Mohamed TAJINE et Loïc MAZO | Reconstruction tomographique d'objets déformables pour la cryo microscopie électronique à particules isolées manuscrit |
2012-2016 | Minh Son PHAN | co-encadrement avec Pr. Mohamed TAJINE et Loïc MAZO | Reconstruction tomographique d’objets articulés à partir de projections non-orientées manuscrit |
2013-2016 | Hmida ROJBANI | Directeurs : Pr. Christian RONSE, Pr. Khaled BSAIES ; encadrement avec Benoît NAEGEL et M. Atef HAMOUDA en co-tutelle avec l'université de Tunis El-Manar | Reconnaissance de forme dans des images volumiques en niveaux de gris - Application à l'imagerie biologique cellulaire. manuscrit |
Stages et projets de recherche
2019 | Maxime SEYER | stage de recherche | M2 | Cas déformable dans la reconstruction tomographique conjointe |
2018 | Romain PERRIN | stage 150h | M2 | Utilisation de DGtal pour l’évaluation des estimateurs avec le dual suite |
2018 | Cyrille MULLER | stage de recherche | M1 | Parallélisation GPU du code de reconstruction tomographique conjointe |
2018 | Chouaib FELLAH | stage de recherche | M1 | Utilisation de DGtal pour l’évaluation des estimateurs avec le dual |
2018 | Etienne LE QUENTREC | stage de recherche | M2 | Comportement multirésolution des estimateurs de longueurs dans l’espace discret 2D |
2017 | Elyes ATEB | stage 150h | M2 | Utilisation de DGtal pour l’évaluation des estimateurs avec le dual |
2017 | Lucas LAZARE | stage de recherche | M1 | Reconstruction conjointe fréquentielle |
2017 | Léo BOUAILLON | stage de recherche | M1 | Dual de l’ensemble des discrétisations à une transformation rigide près |
2017 | Guillaume DECOR | TER | M1 | Polygone et discrétisation |
2017 | Tarek AOULAD-MANSOUR | TER | M1 | Génération de toutes les discrétisations d'une courbe plane |
2016 | Cyrille MULLER | stage de recherche | L3 | optimisation et amélioration du code de reconstruction tomographique conjointe |
2016 | Jean-Romain LUTTRINGER | stage de recherche | L3 | parallélisation et portage sur grille HP du code de reconstruction tomographique conjointe |
2015 | Renan LAURETI | stage de recherche | Magistère de math, 1A | variabilité par translation des discrétisations d’une courbe plane |
2015 | Léo BOUAILLON | stage de recherche | L3 | interface pour la pré-image d'un segment discret |
2015 | Caroline RUDOLF | stage de recherche | L3 | Estimation de la longueur de toutes les discrétisations d'une courbe |
2015 | Sahar HAOUAS | stage de recherche (PFE) | M2 | Reconstruction tomographique par Quadtree à partir de projections non-orientées |
2015 | Zied ZOUCH | stage de recherche (PFE) | M2 | Estimation des orientations et des déformations à partir de projections tomographiques non-orientées |
2014 | Jérémy BERNARD | stage 150 h | M1 | Interface et génération de toutes les discrétisations d’une courbe |
2014 | Maxime ABOVILLIER | stage de recherche | M1 | Reconstruction tomographique à partir de projections non-orientées : accélération par multirésolution |
2014 | Bacem BEN CHEIKH | stage de recherche | M2 | Reconstruction tomographique à partir de projections non-orientées : cas continu 3D |
2013 | Bacem BEN CHEIKH | stage de recherche | M2 | Reconstruction tomographique à partir de projections non-orientées : cas continu 2D |
2012 | Nicolas AUBRY | stage de recherche | M2 | Modélisation discrète de la transformée de Radon en 2D et 3D, implémentation |
2012 | Shan WU | stage de laboratoire | ENSIEE, 2A | Optimisation pour la reconstruction tomographique |
2012 | Grégory APOU | stage de recherche | M1 | suivi de cellules |
2012 | Meryem FATICH | TER | M1 | Reconstruction tomographique à partir de projections non-orientées : cas déformable |
2011 | Célia FILLION | stage de recherche | M2 | Reconstruction tomographique d'une macromolécule à l'aide de ses projections par cryo-microscopie électronique |
2011 | Malo DOUONDA | TER | M1 | Arbres de formes pour la détection de changements : implémentation et expérimentations |
2010 | Diane HOEHLINGER | TER | M1 | Transformée en distance en niveaux de gris et mesure de qualité des images |
2010 | Jérôme VON BUHREN | stage de recherche | Magistère de math, 1A | Propriété de cohérence en tomographie |
2007 | Nathalie GIRARD | stage de recherche | M2 | Evaluation perceptuelle de la qualité de l'image basée sur l'information spatiale locale |
Enseignement
- L1
- CPI
- Algorithmique et programmation 1
- Analyse réelle
- Algèbre
- L3
- Transformation de Fourier
- Base de données
- Fondement statistique de la science des données
- M1
- Cours "Dispositifs d'imagerie médicale" dans le Master Images, Sciences et Technologies de l'Information (Université de Strasbourg)
- Traitement de l'image dans le Master ISI
- M2
- Topologie discrète (support de cours presentation.pdf)
- Tomographie
- Morphologie mathématique Page moodle
Responsabilités collectives
- 2015-16 Membre du comité d'experts de la 27ème section de l'UdS
- 2015- Responsable de la première année du Master ISI
- 2018-2019 Co-responsable de la première année du Master informatique
Publications
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