Alice Dufour
Doctorante
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Activités de recherche
Sujet de thèse : Segmentation et modélisation des structures vasculaires cérébrales en imagerie médicale 3D.
Directeur : Christian Ronse
Co-directeur : Joseph Baruthio
Encadrant : Nicolas Passat
Segmentation vasculaire d'imagerie angiographique 3D
La segmentation des structures vasculaires cérébrales consiste à extraire l'information pertinente contenue dans les images angiographiques (i.e., le volume vasculaire), afin de permettre au radiologue de se focaliser efficacement sur l'analyse de cette information. Des travaux menés en amont et basés sur la morphologie mathématique sont adaptés à la segmentation des structures vasculaires. Ils ont donc été améliorés et appliqués aux images angiographiques 3D.
- Segmentation du réseau artériel cérébral
Image base résolution (En vert : vrai positif, en jaune : faux négatif et en rouge : faux positif). 
Image haute résolution (En vert : vrai positif, en jaune : faux négatif et en rouge : faux positif). 
Vue 3D de la segmentation du polygone de Willis.
Collaborations : Benoît Naegel, Olena Tankyevych, Hugues Talbot et Valérie Wolff
Construction d'un atlas cérébro-vasculaire
L'intégration de connaissances anatomiques dans des processus de segmentation requiert la modélisation préalable de ces connaissances. Le second objectif de cette thèse consiste donc à développer des modèles de représentation de connaissance vasculaire, ainsi que des protocoles de génération pour ces modèles. Cette thématique est relativement nouvelle (le premier protocole automatique de génération de modèle vasculaire cérébral complexe a été réalisé en 2003), et porteuse de réelles perspectives, tant sur le plan de l'aide à la segmentation, que sur celui de données directement utilisables en médecine et en anatomie.
Atlas de densité de présence des vaisseaux cérébraux.
Séparation réseaux artériel (rouge) et veineux (bleu).
Atlas modélisant la taille des vaisseaux. De bleu 0,5mm à rouge 5mm.
Collaborations : Olena Tankyevych et Hugues Talbot
Activités d'enseignement
Année 2012-2013 : IUT Robert Schuman
Semestre 1 :
- P32 : Conception des structures de données.
Semestre 2 :
- S22 : Comprendre et manipuler les systèmes.
Année 2011-2012 : UFR Math-Info
Semestre 1 :
- L2 mention Informatique : Architecture des ordinateurs.
Semestre 2 :
- L2 mention Math-Physique-Chimie : Programmation appliquée. Introduction à Octave
Année 2010-2011 : UFR Math-Info
Semestre 2 :
- L2 mention Math-Physique-Chime : Programmation appliquée. Introduction à Octave.
- L3 mention Mathématique : Programmation orientée objet.
Année 2009-2010 : UFR Math-Info
Semestre 1 :
- L3 mention Science du Vivant : Algorithme et structures de donnée. Introduction au langage C.
Semestre 2 :
- L2 mention Math-Physique-Chime : Programmation appliquée. Introduction à Octave.