Alix Bouchon
Doctorante
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Activités de recherche
Sujet de Thèse
Détection statistique de changements longitudinaux en IRM de diffusion. Application au suivi de maladies neurodégénératives pour des cohortes de patients et de modèles animaux.
Directeur : Fabrice Heitz
Encadrants : Vincent Noblet
Collaboration : Jean-Paul Armspach
Description de la problématique :
Les pathologies dégénératives du système nerveux central (Alzheimer, Sclérose en Plaque, Neuromyélithe optique, …) constituent un enjeu de santé publique majeur. De nombreuses cohortes françaises sont en cours de création dans le cadre des investissements d’avenir (OFSEP, MEMENTO, ..), couplant des données cliniques à des données d’imagerie. Parmi les objectifs de ces cohortes, nous mentionnerons l’étude de l’histoire naturelle des maladies et le suivi pharmaco-épidémiologique des patients traités par médicament.
Cadre :
Cette thèse se situe dans la continuité des travaux en cours au sein des équipes MIV et IMIS de ICUBE, sur le suivi longitudinal en IRM morphologique et en imagerie de diffusion.
Elle fait suite à deux autres thèses spécifiquement dédiées à la détection de changements en imagerie de diffusion (IRMd) : le thèse de Hervé Boisgontier (soutenue en 2010) et la thèse d'Antoine Grigis (soutenue en 2012), avec pour pathologies cibles la Sclérose en Plaques (SEP) et la Neuromyélite Optique (NMO). Ces travaux ont d'ores et déjà conduit au développement de modèles et d'algorithmes permettant le suivi et la détection statistique de changements en IRM de diffusion pour un sujet.
Objectifs de la thèse :
L’objet de cette thèse est de poursuivre ces travaux par le développement de nouveaux paradigmes permettant le suivi longitudinal de groupes de sujets, avec application aux cohortes en cours de constitution. L’objectif sera en particulier de détecter des changements au sein d’une population de sujets en y intégrant des variables explicatives cliniques de type cognitif par exemple. Une deuxième étape sera d’introduire le caractère multi-séquence (multimodal) de l’IRM et de détecter des changements en combinant des informations complémentaires comme par exemple l’imagerie anatomique et l’imagerie de diffusion. Enfin il s’agira également de comparer les évolutions observées sur plusieurs groupes (groupes tests et témoins, …).
Enseignements
Année 2012 - 2013 : Télécom Physique Strasbourg TPS - Mission d'enseignements (64h)
- Semestre 1 :
- TPS 2A : TP Traitement numérique du signal 1D
- Semestre 2 :
- TPS 2A : TP Traitement du signal bidimensionnel et des images
Année 2013 - 2014 : Télécom Physique Strasbourg TPS - Mission d'enseignements (64h)
- Semestre 1 :
- TPS 2A : TP Traitement numérique du signal 1D
- TPS 1A : TP Outils Numériques (Matlab)
Année 2015 - 2016 : Télécom Physique Strasbourg TPS - Poste d'ATER (192h)
- Semestre 1 :
- TPS 1A : TP Outils numériques (matlab) (24h)
- TPS 1A : TP Analyse numérique (32h)
- TPS 2A : TD Traitement du signal 1D (10.5h)
- TPS 2A : TP Traitement du signal 1D (26.5h)
- TPS 2A : TP Traitement du signal stochastique 1D (17.5h)
- TPS 3A : TP Outils fondamentaux en traitement des images (7h)
- Semestre 2 :
- TPS 1A : TD Traitement du signal 1D (35h)
- TPS 1A : TD Probabilités (17.5h)
- TPS 2A : TP Traitement des images (12h)
- TPS 2A : TP Télécommunications (10.5h)
Publications
<anyweb>http://icube-publis.unistra.fr/?author=Bouchon&title=&team=&national=&project=&year1=1979&year2=2016&=</anyweb>